中华绒螯蟹育种群体遗传特征分析及性早熟相关SNP标记筛选
发布时间：2023-08-29 22:55
中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)俗称河蟹,主要分布于中国长江、辽河、瓯江等水域,但群体自然分布以长江流域为主。多年来,由于各水系中华绒螯蟹无序引种和培育苗种的盲目放流,加上人工养殖群体向自然水体的逃逸,打破了各水系中华绒螯蟹的天然分布格局,各水系群体间的基因交流非常频繁,由此产生了中华绒螯蟹的种质混杂问题。因此,进行长江水系中华绒螯蟹优良品系选育已成当务之急。本研究采用微卫星技术分析了选育过程中所构建的3个育种基础群体的遗传特征,以期为后期深入开展长江水系中华绒螯蟹优良品系选育积累有益资料。近年来,在各地的养殖过程中普遍发生一龄蟹的性早熟现象。性早熟直接导致河蟹生长缓慢甚至停滞,个体小,死亡率高,严重制约了河蟹养殖业的发展,给生产带来了巨大损失。本研究在假设蜕皮抑制激素基因(MIH基因)变异与中华绒螯蟹性早熟之间存在相关性的基础上,尝试鉴定MIH基因调控区和编码区的SNPs位点,然后对鉴定出的所有SNPs位点在性早熟蟹和正常扣蟹中进行基因分型,并对两个群体中差异显著的SNPs位点与中华绒螯蟹性早熟的关联性进行了分析。 为进行长江水系中华绒螯蟹优良品系选育,本研究利用1...
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 绪论
1 中华绒螯蟹种质混杂及性早熟机制研究进展
1.1 中华绒螯蟹种质混杂
1.2 中华绒螯蟹性早熟机制研究进展
1.2.1 外在因素
1.2.1.1 温度
1.2.1.2 盐度
1.2.1.3 光照
1.2.1.4 营养
1.2.1.5 放养密度
1.2.2 内在因素
1.2.2.1 种质和性别
1.2.2.2 神经内分泌系统
1.2.2.3 类固醇激素
1.2.2.4 肝胰腺
2 DNA分子标记技术在水产动物遗传育种中的应用
2.1 DNA分子标记技术简介
2.2 DNA分子标记技术在水产动物遗传育种中的应用
2.2.1 水产动物遗传多样性分析
2.2.2 水产动物种质鉴定
2.2.3 水产动物亲缘关系研究
2.2.4 水产动物亲子鉴定
2.2.5 水产动物遗传连锁图谱构建
2.2.6 水产动物QTL定位
2.2.7 水产动物分子标记辅助育种
2.3 展望
3 研究设想
第二章 中华绒螯蟹3个育种基础群体遗传特征的微卫星分析
1 材料与方法
1.1 实验材料与仪器
1.1.1 材料获取
1.1.2 实验仪器
1.2 微卫星引物
1.3 方法
1.3.1 DNA模板制备
1.3.2 基因组DNA的检测及浓度测定
1.3.3 PCR扩增与SSR引物筛选
1.3.4 PCR产物的检测
1.3.4.1 琼脂糖凝胶电泳检测
1.3.4.2 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测
1.3.5 数据统计与分析
2 结果与分析
2.1 各基因位点的遗传多态
2.2 Hardy-Weinberg平衡
2.3 3个群体间的遗传分化
3 讨论
3.1 3个育种基础群体的遗传多样性
3.2 3个育种基础群体杂合子缺失现象的原因分析
3.3 3个育种基础群体的遗传结构
第三章 中华绒螯蟹MIH基因变异及其与性早熟的关联性分析
1 材料与方法
1.1 实验材料
1.2 SNPs筛选
1.3 MIH基因分型
1.4 统计分析
2 结果与分析
2.1 调控区结果
2.1.1 鉴定的SNPs
2.1.2 SNPs位点在性早熟及正常河蟹群体中的分布
2.1.3 基因型与性早熟之间的关联性
2.2 编码区结果
2.2.1 鉴定的SNPs
2.2.2 SNPs位点在性早熟及正常河蟹群体中的分布
2.2.3 基因型与性早熟之间的关联性
3 讨论
第四章 结论
参考文献
缩略词
在读期间发表的学术论文与研究成果
致谢
本文编号：3844448
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 绪论
1 中华绒螯蟹种质混杂及性早熟机制研究进展
1.1 中华绒螯蟹种质混杂
1.2 中华绒螯蟹性早熟机制研究进展
1.2.1 外在因素
1.2.1.1 温度
1.2.1.2 盐度
1.2.1.3 光照
1.2.1.4 营养
1.2.1.5 放养密度
1.2.2 内在因素
1.2.2.1 种质和性别
1.2.2.2 神经内分泌系统
1.2.2.3 类固醇激素
1.2.2.4 肝胰腺
2 DNA分子标记技术在水产动物遗传育种中的应用
2.1 DNA分子标记技术简介
2.2 DNA分子标记技术在水产动物遗传育种中的应用
2.2.1 水产动物遗传多样性分析
2.2.2 水产动物种质鉴定
2.2.3 水产动物亲缘关系研究
2.2.4 水产动物亲子鉴定
2.2.5 水产动物遗传连锁图谱构建
2.2.6 水产动物QTL定位
2.2.7 水产动物分子标记辅助育种
2.3 展望
3 研究设想
第二章 中华绒螯蟹3个育种基础群体遗传特征的微卫星分析
1 材料与方法
1.1 实验材料与仪器
1.1.1 材料获取
1.1.2 实验仪器
1.2 微卫星引物
1.3 方法
1.3.1 DNA模板制备
1.3.2 基因组DNA的检测及浓度测定
1.3.3 PCR扩增与SSR引物筛选
1.3.4 PCR产物的检测
1.3.4.1 琼脂糖凝胶电泳检测
1.3.4.2 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测
1.3.5 数据统计与分析
2 结果与分析
2.1 各基因位点的遗传多态
2.2 Hardy-Weinberg平衡
2.3 3个群体间的遗传分化
3 讨论
3.1 3个育种基础群体的遗传多样性
3.2 3个育种基础群体杂合子缺失现象的原因分析
3.3 3个育种基础群体的遗传结构
第三章 中华绒螯蟹MIH基因变异及其与性早熟的关联性分析
1 材料与方法
1.1 实验材料
1.2 SNPs筛选
1.3 MIH基因分型
1.4 统计分析
2 结果与分析
2.1 调控区结果
2.1.1 鉴定的SNPs
2.1.2 SNPs位点在性早熟及正常河蟹群体中的分布
2.1.3 基因型与性早熟之间的关联性
2.2 编码区结果
2.2.1 鉴定的SNPs
2.2.2 SNPs位点在性早熟及正常河蟹群体中的分布
2.2.3 基因型与性早熟之间的关联性
3 讨论
第四章 结论
参考文献
缩略词
在读期间发表的学术论文与研究成果
致谢
本文编号：3844448
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