拟缘（鱼央）（Liobagrus marginatoides）遗传多样性及其种群结构分析

发布时间：2024-02-24 12:13

　　拟缘鱼央（Liobagrus marginatoides），隶属硬骨鱼纲（Teleostei）、鲇形目（Siluriformes)、钝头鮠科(Amblycipitidae)、鱼央属(Liobagrus)，是我国长江上游水系特有的一种小型鱼类。通常长江上游水系，包括：长江干流、金沙江、岷江、嘉陵江等，近年来长江上游水系大规模兴建了一系列的梯级水电工程以及水体污染等因素，在很大程度上改变了拟缘鱼央生存流域的环境。因此，为了了解拟缘鱼央遗传多样性及其种群遗传结构情况，本文从核基因组和线粒体基因组入手，利用自开发的微卫星分子标记和线粒体基因组DNA分子标记，对采集于长江上游水系的拟缘鱼央6个地理种群进行数据分析,主要的研究结果有如下几方面： 1.利用线粒体DNA对拟缘鱼央进行种群遗传结构分析 （1）通过对鱼央属4种鱼：黑尾鱼央、白缘鱼央、金氏鱼央、拟缘鱼央，线粒体基因组序列进行比对分析，筛选出16SRNA、D-loop、Cytb基因作为拟缘鱼央遗传结构分析的分子标记。利用16SRNA分子标记对142条拟缘鱼央序列进行分析，共检测出26个变异位点、11个单倍型，单倍型多样性（Hd）和核苷酸多样性...

【文章页数】：70 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1-1拟缘鱼央采样图

群体遗传结构往往能提供非常丰富的遗传变异数据；16sRNA进化速大多用于种间的遗传学分析。此，本研究拟采用Cytb、D-loop、16sRNA这三个线粒体片段来进传多样性和种群遗传结构分析。料和方法材料批6个群体的拟缘鱼央样本采集于2011年3月到20....

图2-3基于mtDNA16sRNA基因构建的拟缘鱼央单倍型网络结构图

重庆师范大学硕士学位论文第二章拟缘鱼央线粒体DN使用Network4.6.1软件的Median-joining方法构建拟缘网络结构图，该单倍型网络结构图显示了单倍型在拟缘鱼央6个群体况。H-1共有115个个体，位于网络结构图辐射的中心位置，在有分布，因此分....

图2-6拟缘鱼央D-loop单倍型网络结构图，圆圈面积表示单倍型分布频率

图2-6拟缘鱼央D-loop单倍型网络结构图，圆圈面积表示单倍型分布频率Fig.2-6HaplotypenetworkofL.MarginatoidesbasedonD-loopofmtDNA用DNASP5.10软件分析基因渗透对拟缘鱼央各群体遗传....

图2-7基于D-loop拟缘鱼央群体Mismatch分布图

图2-7基于D-loop拟缘鱼央群体Mismatch分布图Fig.2-7MismatchdistributionofL.MarginatoidesbasedonD-loop2.3.3线粒体cytb2.3.3.1遗传多样性145尾拟缘鱼央线粒体....

本文编号：3908975