大菱鲆生长性状相关SNP位点的筛选鉴定及生物信息学分析

发布时间：2024-03-08 21:49

　　大菱鲆(Scophthalmus maximus L.)是原产于欧洲沿海的一种名贵的比目鱼。自我国1992年从英国引进以来,因其生长速度快、肉质鲜美、易驯化以及抗逆性强等特点,迅速成为北方海水养殖的主要经济鱼类。然而,近几年,随着工厂化养殖水平的不断提高,大菱鲆养殖产业出现一些问题。由于大菱鲆育种工作主要依赖国外引进亲本,亲本资源有限,加上累代养殖以及近亲交配,使得大菱鲆种质资源退化严重,严重制约了大菱鲆养殖业的可持续发展。因此对大菱鲆进行遗传改良,选育具有优良生长性状的大菱鲆新品种是发展大菱鲆养殖业的当务之急。随着生物技术的不断创新与进步,分子标记技术被运用到育种工作中来,利用传统育种加上分子标记辅助育种的模式已经成为鱼类育种的有效手段。单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是微卫星标记之后的第三代的分子标记技术。SNP标记在基因组中密度高,遗传稳定性好并且易于自动化分析,因此被广泛地应用于动植物的遗传育种中。本研究以实验室前期利用数量性状位点(QTL)定位作图筛选获得的100个与大菱鲆生长性状相关的候选单核苷酸多态(SNP)位点为基础...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图2-1基因组DNA琼脂糖凝胶电泳检测图

3.1基因组DNA质量及浓度检测提取的大菱鲆鳍条组织的基因组DNA用1%的琼脂糖凝胶电泳检测，部分样品的电泳检测结果见图2-1。图中可见基因组DNA条带明亮且无明显的拖带现象，完整性较好，符合SNP位点分型的条件。利用超微量紫外光分光光度计检测样品DNA的浓度和....

图2-2SNP位点变异类型统计图

图2-2SNP位点变异类型统计图Figure2-2DistributionofSNPvariationsSNP位点与生长性状关联分析大菱鲆四个家系生长性状（体重和体长）数据见表2-2。利用一般线性模型LM）对SNP位点的基因型和生长性状进行关联分析，结果见....

图4-1大菱鲆各组织总RNA电泳图

图4-1大菱鲆各组织总RNA电泳图Figure4-1ElectrophorctogramoftotalRNAoftissueinturbot3.2大菱鲆NOTCH1基因cDNA片段克隆取大菱鲆心脏组织的RNA，反转录成cDNA，以此为模板，....

图4-2大菱鲆NOTCH1基因序列比对结果

39图4-2大菱鲆NOTCH1基因序列比对结果Figure4-2SequencealignmentresultsofNOTCH1geneinturbot表4-3大菱鲆NOTCH1基因序列在NCBI数据库同源比对结果Table4-3Homo....

本文编号：3922433