四种壳色马氏珠母贝群体遗传多样性分析和分子标记研究
发布时间：2024-03-23 21:53
马氏珠母贝(Pinctada martensii Dunker)又称合浦珠母贝,是我国生产海水珍珠的重要经济贝类之一,既可作肉贝又可用于生产海水珍珠,生产的南海珍珠享誉世界。而近年来,由于环境条件恶化及不科学的养殖繁育方式等导致种质资源严重退化,珍珠产量及质量下降,企业经济受损严重,因此迫切需要对马氏珠母贝进行遗传多样性分析,优化选育、遗传改良、分子标记选育及保护其种质资源等方面的研究。本研究采用EST-SSR微卫星标记技术、相关序列扩增多态性标记技术(SRAP-c DNA)、单核苷酸多态性标记(SNP)技术等分析了四种壳色马氏珠母贝群体的遗传多样性、筛选出壳色相关分子标记和壳色相关基因酪氨酸酶基因的SNP位点及在四种壳色群体中的表达量差异。旨在为经过8代的群体继代选育获得的四种壳色马氏珠母贝群体的种质鉴定和壳色选育提供分子理论依据。主要研究结果如下:1、本研究采用10对微卫星引物,对四种壳色马氏珠母贝群体的遗传多样性和群体结构进行了研究,结果显示:(1)10个位点共检测到45个等位基因,各位点平均等位基因数4.5个,四种壳色马氏珠母贝群体的平均等位基因(Na)为3.54
【文章页数】：97 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 文献综述
1.1 马氏珠母贝的研究进展
1.1.1 马氏珠母贝简介
1.1.2 马氏珠母贝的遗传育种
1.2 微卫星分子标记的功能特征和应用
1.2.1 微卫星分子标记发展历程
1.2.2 微卫星在遗传育种领域的应用
1.3 SRAP分子标记的功能特征和应用
1.3.1 SRAP分子标记的概念及原理
1.3.2 SRAP分子标记的应用
1.4 SNP分子标记的功能特征和应用
1.4.1 SNP分子标记及特点
1.4.2 SNP筛选检测方法
1.5 酪氨酸酶基因
1.5.1 酪氨酸酶简介
1.5.2 酪氨酸酶生理功能与活性中心结构
1.5.3 酪氨酸酶的应用及研究进展
1.6 研究内容及意义
2 四种壳色马氏珠母贝EST-SSR遗传多样性分析
2.1 材料与方法
2.1.1 材料
2.1.2 实验仪器与试剂
2.1.3 实验方法
2.1.4 数据处理与分析
2.2 实验结果与分析
2.2.1 实验结果
2.2.2 数据结果分析
2.3 讨论
2.3.1 四种壳色马氏珠母贝群体内遗传多样性分析
2.3.2 四种壳色马氏珠母贝群体哈迪温伯格平衡
2.3.3 四种壳色马氏珠母贝群体间的遗传分化
3 四种壳色马氏珠母贝外套膜基因的SRAP-cDNA差异分析
3.1 材料与方法
3.1.1 材料来源
3.1.2 实验仪器与试剂
3.1.3 实验方法
3.2 实验结果与分析
3.2.1 外套膜组织RNA检测结果
3.2.2 以cDNA的为模板SRAP-cDNA引物PCR扩增检测结果
3.2.3 SRAP-cDNA引物筛选
3.2.4 SRAP-cDNA引物验证
3.2.5 琼脂糖胶回收
3.2.6 克隆测序结果
3.3 讨论
3.3.1 四种壳色马氏珠母贝群体的SRAP-cDNA表达差异
3.3.2 差异条带的同源性序列
3.3.3 四种壳色马氏珠母贝群体的鉴定标记
4 马氏珠母贝酪氨酸酶基因SNP位点筛选和表达量分析
4.1 材料与方法
4.1.1 实验材料
4.1.2 主要实验仪器和试剂
4.1.3 实验方法
4.1.4 数据处理
4.2 实验结果与分析
4.2.1 酪氨酸酶基因PCR扩增产物琼脂糖检测
4.2.2 荧光定量PCR扩增产物
4.2.3 酪氨酸酶基因扩增序列和峰值图
4.2.4 测序分析
4.2.5 SNP位点基因型分析
4.2.6 SNP位点等位基因频率分析
4.2.7 多重比较及关联性分析
4.2.8 SNP位点多态性分析
4.2.9 四种壳色马氏珠母贝群体酪氨酸酶基因相对表达量
4.3 讨论
4.3.1 四种壳色马氏珠母贝群体总体的SNP位点差异分析
4.3.2 四种壳色马氏珠母贝群体间的SNP位点差异分析
4.3.3 不同壳色马氏珠母贝群体总体SNP位点基因型分布规律讨论
4.3.4 SNP位点多态性分析
4.3.5 酪氨酸酶基因表达量分析
5 结论
论文的创新点
有待解决的问题
参考文献
致谢
作者简介
导师简介
本文编号：3936518
【文章页数】：97 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 文献综述
1.1 马氏珠母贝的研究进展
1.1.1 马氏珠母贝简介
1.1.2 马氏珠母贝的遗传育种
1.2 微卫星分子标记的功能特征和应用
1.2.1 微卫星分子标记发展历程
1.2.2 微卫星在遗传育种领域的应用
1.3 SRAP分子标记的功能特征和应用
1.3.1 SRAP分子标记的概念及原理
1.3.2 SRAP分子标记的应用
1.4 SNP分子标记的功能特征和应用
1.4.1 SNP分子标记及特点
1.4.2 SNP筛选检测方法
1.5 酪氨酸酶基因
1.5.1 酪氨酸酶简介
1.5.2 酪氨酸酶生理功能与活性中心结构
1.5.3 酪氨酸酶的应用及研究进展
1.6 研究内容及意义
2 四种壳色马氏珠母贝EST-SSR遗传多样性分析
2.1 材料与方法
2.1.1 材料
2.1.2 实验仪器与试剂
2.1.3 实验方法
2.1.4 数据处理与分析
2.2 实验结果与分析
2.2.1 实验结果
2.2.2 数据结果分析
2.3 讨论
2.3.1 四种壳色马氏珠母贝群体内遗传多样性分析
2.3.2 四种壳色马氏珠母贝群体哈迪温伯格平衡
2.3.3 四种壳色马氏珠母贝群体间的遗传分化
3 四种壳色马氏珠母贝外套膜基因的SRAP-cDNA差异分析
3.1 材料与方法
3.1.1 材料来源
3.1.2 实验仪器与试剂
3.1.3 实验方法
3.2 实验结果与分析
3.2.1 外套膜组织RNA检测结果
3.2.2 以cDNA的为模板SRAP-cDNA引物PCR扩增检测结果
3.2.3 SRAP-cDNA引物筛选
3.2.4 SRAP-cDNA引物验证
3.2.5 琼脂糖胶回收
3.2.6 克隆测序结果
3.3 讨论
3.3.1 四种壳色马氏珠母贝群体的SRAP-cDNA表达差异
3.3.2 差异条带的同源性序列
3.3.3 四种壳色马氏珠母贝群体的鉴定标记
4 马氏珠母贝酪氨酸酶基因SNP位点筛选和表达量分析
4.1 材料与方法
4.1.1 实验材料
4.1.2 主要实验仪器和试剂
4.1.3 实验方法
4.1.4 数据处理
4.2 实验结果与分析
4.2.1 酪氨酸酶基因PCR扩增产物琼脂糖检测
4.2.2 荧光定量PCR扩增产物
4.2.3 酪氨酸酶基因扩增序列和峰值图
4.2.4 测序分析
4.2.5 SNP位点基因型分析
4.2.6 SNP位点等位基因频率分析
4.2.7 多重比较及关联性分析
4.2.8 SNP位点多态性分析
4.2.9 四种壳色马氏珠母贝群体酪氨酸酶基因相对表达量
4.3 讨论
4.3.1 四种壳色马氏珠母贝群体总体的SNP位点差异分析
4.3.2 四种壳色马氏珠母贝群体间的SNP位点差异分析
4.3.3 不同壳色马氏珠母贝群体总体SNP位点基因型分布规律讨论
4.3.4 SNP位点多态性分析
4.3.5 酪氨酸酶基因表达量分析
5 结论
论文的创新点
有待解决的问题
参考文献
致谢
作者简介
导师简介
本文编号：3936518
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