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赤点石斑神经坏死病毒感染GF-1和SSN-1细胞的microRNA组与转录组研究

发布时间:2024-04-03 05:21
  鱼类神经坏死病毒(Nervous necrosis virus,NNV)也称为β野田病毒(betanodavirus),是野田病毒(Nodaviridae)家族的一员。NNV感染导致的疾病称为病毒性神经坏死症(viral nervous necrosis,VNN)或者病毒性脑病和视网膜病(viral encephalopathy and retinopathy,VER),最初分离自患病的海洋鱼类,现在已在120多种不同的养殖和野生鱼类中被报道,严重危害着水产养殖业。近年来,越来越多的证据表明NNV开始在淡水鱼类中流行,感染实验也表明很多淡水鱼类容易受到NNV感染。虽然各国学者在NNV感染的预防和治疗方面投入了大量的研究,但对NNV致病的分子机制还没有完全阐明。通过研究赤点石斑神经坏死病毒(Red-spotted grouper nervous necrosis virus,RGNNV)感染敏感细胞系的microRNA(miRNA)表达谱和转录组测序,可以获得大量RGNNV和宿主相互作用的信息,这些结果将有助于了解RGNNV的复制和致病机制,进而为VER的综合防控提供新的策略。虽然目前已...

【文章页数】:214 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

图1-1鱼类野田病毒结构示意图(引自:ViralZone)

图1-1鱼类野田病毒结构示意图(引自:ViralZone)

图1-1鱼类野田病毒结构示意图(引自:ViralZone)Fig.1-1SchematicdiagramofthestructureofBetanodavirus毒切面示意图;右图为鱼类野田病毒外壳示意图:球形,无囊膜,T=3的二十面自:Viralzone....


图1-2赤点石斑神经坏死病毒基因组结构示意图

图1-2赤点石斑神经坏死病毒基因组结构示意图

赤点石斑神经坏死病毒感染GF-1和SSN-1细胞的microRNA组与转录组研究图1-1鱼类野田病毒结构示意图(引自:ViralZone)Fig.1-1SchematicdiagramofthestructureofBetanodavirus是鱼....


图2-1小RNA文库构建流程(引自Biomaker)

图2-1小RNA文库构建流程(引自Biomaker)

USA)进行文库构建。由于SmallRNA的5'端有磷酸基团,3'端有羟基,利用NALigase1和T4RNALigase2(truncated)分别在smallRNA3'端和5'端连接上,反转录合成cDNA,PCR扩增,使用15%PAG....


图2-2polyA加尾法qRT-PCR原理(引自GeneCopoeia)

图2-2polyA加尾法qRT-PCR原理(引自GeneCopoeia)

图2-2polyA加尾法qRT-PCR原理(引自GeneCopoeia)Fig.2-2SchematicofpolyAtaledqRT-PCR.10qRT-PCR验证差异表达miRNA由于成熟的miRNA(maturemiRNA)长度仅为2....



本文编号:3946780

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