长江上游圆筒吻鮈遗传结构分析

发布时间：2024-04-14 06:04

　　圆筒吻鮈(Rhinogobio cylindricus)是长江中上游及其支流的特有鱼类。近年来,随着水电工程、环境污染、过度捕捞、外来物种入侵等多因素的干扰,使水生生物多样性面临巨大的挑战。三峡大坝蓄水水位的不断提高,向家坝水利工程的投入使用,都严重影响长江上游鱼类的栖息地和生物量,圆筒吻鮈的群体数量也相应减少。为了对圆筒吻鮈的生物资源提供有效保护,必须对其遗传结构有充分的了解。本文采用两种分子标记(线粒体DNA分子标记和微卫星标记)探讨长江上游宜宾(YB)、万州(WZ)、江津(JJ)和合江(HJ)四个圆筒吻鮈群体的遗传结构。研究结果主要如下：(1)分析了122尾圆筒吻鮈的线粒体Cyt b序列,共检测出22个单倍型,62个变异位点,圆筒吻鮈种群平均单倍型多样性指数为0.716,平均核营酸多样性指数为0.01006,单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数最高的均为宜宾群体。分析112尾圆筒吻鮈的控制区序列,共检测出30个单倍型,60个变异位点,平均单倍型多样性指数为0.840,其中单倍型多样性最高的为宜宾群体,平均核苷酸多样性指数为0.01278,核苷酸多样性指数最高的为万州群体。合江(HJ...

【文章页数】：67 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图2-1基于线粒体DNACytb基因构建的圆筒吻的Cy

西南大学硕ｉｆｃ学位论文??Ｈａｐ＿＿ｌ、Ｈａｐ＿２位于图中最基础的位置，推测其可能为较原始的单倍型，其他单??倍型均由上述两个单倍型经一步或者多步突变而形成。??

图３－１微卫星多态弓Ｉ物筛选??Ｆｉｇ．?３－１?Ｔｈｅ?ＰＡＧＥ?ｒｅｓｕｌｔｓ?ｏｆ?ｒｔｉｅｉｒ?ａｃｃｒｏｄｉｎｇ?ｓｉｎｇｌｅ?ｐｒｉｍｅｒ?ｓｅｔ?ＰＣＲ??

°Ｃ、５８．４１：、巧．２°Ｃ、：５９．７’Ｃ和６０°Ｃ。部分引物多态筛选和Ｈ重ＰＣ民结果如??下图所示（图３－１）。最终实验结果确定组合Ａ的最佳退火温度为５０’Ｃ、组合Ｂ??的最佳退火温度为５ｒｃ、姐合Ｃ的最佳退火温度为５ｒｃ。??．?ｌｒ：ｊ．?＂？一ｈｂｗ??１?２?．屬?....

图2-1基于线粒体DNACytb基因构建的圆筒吻的Cy

西南大学硕ｉｆｃ学位论文??Ｈａｐ＿＿ｌ、Ｈａｐ＿２位于图中最基础的位置，推测其可能为较原始的单倍型，其他单??倍型均由上述两个单倍型经一步或者多步突变而形成。??

图３－１微卫星多态弓Ｉ物筛选??Ｆｉｇ．?３－１?Ｔｈｅ?ＰＡＧＥ?ｒｅｓｕｌｔｓ?ｏｆ?ｒｔｉｅｉｒ?ａｃｃｒｏｄｉｎｇ?ｓｉｎｇｌｅ?ｐｒｉｍｅｒ?ｓｅｔ?ＰＣＲ??

°Ｃ、５８．４１：、巧．２°Ｃ、：５９．７’Ｃ和６０°Ｃ。部分引物多态筛选和Ｈ重ＰＣ民结果如??下图所示（图３－１）。最终实验结果确定组合Ａ的最佳退火温度为５０’Ｃ、组合Ｂ??的最佳退火温度为５ｒｃ、姐合Ｃ的最佳退火温度为５ｒｃ。??．?ｌｒ：ｊ．?＂？一ｈｂｗ??１?２?．屬?....

本文编号：3954233