互花米草NAC转录因子家族的鉴定与表达分析

发布时间：2021-12-31 02:40

　　互花米草（Spartina alterniflora）作为一种海岸带盐生植物,高度耐盐胁迫,但因为缺少参考基因组,其耐盐的分子机制却尚未见报道。NAC家族蛋白是植物特有的转录因子,调控植物的生长发育和胁迫应答。为了鉴定互花米草NAC蛋白（Sa NAC）并探究它们与互花米草生长发育及胁迫响应之间的关系,本研究以互花米草三代全长转录组数据为参考,通过与水稻（Oryza sativa）、拟南芥（Arabidopsis thaliana）和玉米（Zea mays）NAC蛋白序列进行比对,并结合保守功能域进一步筛选,最终找到62个Sa NAC蛋白。从蛋白序列比对、进化、motif预测、同源性比较、亚细胞定位、组织表达以及非生物胁迫下的基因差异表达等方面分别对互花米草NAC家族成员进行分析,结果发现Sa NAC蛋白均含有保守的NAM结构域,且在进化上与水稻NAC家族具有一定的相似性;Sa NAC家族中的两个蛋白Sa NAC9和Sa NAC49在细胞核表达;另外,本研究还发现互花米草Sa NAC基因表达具有高度组织和胁迫应答差异性。这些结果表明互花米草NAC转录因子家族不仅具有保守的功能域,而且在调... 

【文章来源】：遗传. 2020,42(02)北大核心CSCD

【文章页数】：18 页

【参考文献】：
期刊论文
[1]乌拉尔图小麦NAC转录因子的筛选与分析[J]. 马建辉,仝豆豆,张文利,张黛静,邵云,杨云,姜丽娜.  遗传. 2016(03)
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本文编号：3559468