香樟1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶基因的克隆与表达分析

发布时间：2022-01-20 06:43

　　本研究通过克隆香樟植物的1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶（DXS）基因,进行生物信息学分析,为香樟DXS基因的功能及其表达调控提供基础。根据香樟转录组数据中注释为DXS的核苷酸拼接序列,设计特异性引物,进行香樟DXS基因的克隆,应用荧光定量PCR方法分析DXS基因在香樟根、茎和叶中的表达量。克隆获得香樟DXS基因,其c DNA序列长度为2 333 bp,开放读码阅读框（ORF）为2 187 bp,编码728个氨基酸,含有转酮醇酶等3个保守结构域。香樟DXS蛋白定位于叶绿体,是一个不含信号肽、无跨膜结构域的亲水性稳定蛋白,且蛋白二级结构主要为α-螺旋和无规则卷曲。通过氨基酸序列同源性分析发现,香樟DXS氨基酸序列与黄兰和鱼腥草的DXS氨基酸序列相似性较高,均为85%。分子进化树结果表明,香樟DXS蛋白与黄兰DXS蛋白亲缘关系较近。组织特异性表达分析结果显示,DXS在香樟叶与茎中的表达量高于根。成功克隆获得香樟DXS基因,研究结果为进一步探讨香樟DXS基因在萜类物质生物合成途径中的作用提供理论依据。 

【文章来源】：基因组学与应用生物学. 2020,39(08)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

PCR扩增香樟DXS基因

CcDXS的ORF序列及其编码蛋白质的氨基酸序列

香樟DXS三级结构建模

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
[1]大豆萜类非甲羟戊酸代谢途径关键酶基因的克隆及功能鉴定[D]. 张曼.南京农业大学 2008



本文编号：3598357