hsa-miR-150-5p的生物信息学分析

发布时间：2022-07-29 14:24

　　目的探讨hsa-miR-150-5p在其基因家族的进化关系及可能介入的生物学过程。方法利用人类miRNA表达数据库（HMED）获得hsa-miR-150-5p在不同组织和疾病中特异性表达丰度信息,运用miRBase、Clustalw2和MEGA5.0分析软件获取hsa-miR-150-5p的染色体定位、碱基序列比对特征和进化规律等基本信息,通过miRDB、PicTar和TargetScan进行靶基因预测,采用基因本体（GO）和代谢通路富集分析（KEGG）对靶基因的生物学功能注释分析,进一步认识hsa-miR-150-5p的生物学功能。结果通过同源性搜索在miRBase数据中获得miR-150基因家族成员的序列36条,分布于23个物种。多序列比对发现miR-150基因家族成员序列碱基保守性很高,其中有16个碱基完全保守,6个碱基相对保守。进化分析表明人类的miR-150与青鳉、三文鱼、钳鱼、斑马鱼的分子系统进化关系较远,与其他18个物种的进化关系较近。对miRDB、PicTar和TargetScan预测的靶基因进行交集后共得到25个靶基因,GO分析结果显示靶基因参与多个信号通路的调节,包... 

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 hsa-miR-150-5p表达谱分析
        1.2.2 序列分析
        1.2.3靶基因预测及功能注释
2 结果
    2.1 hsa-miR-150-5p表达谱
    2.2 miR-150基因家族成员的分布特征分析
    2.3 hsa-miR-150-5p序列同源性分析
    2.4 miR-150基因家族成员系统进化分析
    2.5 miR-150靶基因预测及功能分析
3 讨论



本文编号：3666627