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西北太平洋五种海洋鱼类的分子系统地理学研究

发布时间:2021-03-12 02:24
  本文以西北太平洋小黄鱼(Larimichthys polyactis)、高眼鲽(Cleisthenes herzensteini)、斯氏美首鲽(Glyptocephalus stelleri)、长鲽(Tanakius kitaharai)、白氏文昌鱼(branchiostoma belcheri)和带鱼(Trichiurus japonicus)为研究对象,采用线粒体DNA分子标记技术对这六种海洋物种的分子系统地理学进行了研究,系统研究了这五种鱼类和文昌鱼的分子系统地理分布模式,阐述了五种海洋鱼类和文昌鱼的遗传多样性水平和遗传结构现状,探讨了其群体动态历史的演化过程,揭示历史因素(更新世冰期等)和当前环境因素(洋流等)对塑造海洋鱼类群体遗传结构和分子系统地理分布模式的重要作用。主要研究结果如下:1、研究了小黄鱼群体遗传多样性水平、遗传结构现状及其群体动态历史,对小黄鱼分布区内16个群体共298个个体的线粒体DNA控制区第一高变区序列进行了测定和分析。在小黄鱼控制区序列上检测到了高水平的基因多样度,揭示小黄鱼存在较高水平的遗传多样性。分子方差分析(AMOVA)和两两群体相比较的FST结果... 

【文章来源】:中国海洋大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:156 页

【学位级别】:博士

【文章目录】:
中文摘要
英文摘要
第一章 分子系统地理学在海洋鱼类中的研究进展
    1.1 前言
    1.2 发展简史
    1.3 研究内容
    1.4 种内系统地理格局的影响因素
        1.4.1 外部因素
        1.4.2 内部因素
    1.5 西北太平洋分子系统地理学研究
第二章 小黄鱼群体遗传多样性和群体遗传结构研究
    2.1 前言
    2.2 材料与方法
        2.2.1 实验材料
        2.2.2 基因组DNA提取
        2.2.3 PCR扩增
        2.2.4 序列测定
        2.2.5 数据分析
    2.3 结果
        2.3.1 种内序列多态
        2.3.2 遗传学关系
        2.3.3 群体历史动态
        2.3.4 群体遗传结构
    2.4 讨论
        2.4.1 遗传多态性研究
        2.4.2 群体遗传结构研究
第三章 高眼鲽群体遗传结构研究
    3.1 前言
    3.2 材料与方法
        3.2.1 实验材料
        3.2.2 基因组DNA提取
        3.2.3 PCR扩增
        3.2.4 序列测定
        3.2.5 数据分析
    3.3 结果
        3.3.1 种内序列多态
        3.3.2 NCPA分析
        3.3.3 群体遗传结构分析
        3.3.4 群体历史动态
    3.4 讨论
        3.4.1 遗传多态性研究
        3.4.2 群体遗传结构研究
        3.4.3 群体动态历史研究
第四章 斯氏美首鲽分子系统地理学研究
    4.1 前言
    4.2 材料与方法
        4.2.1 实验材料
        4.2.2 基因组DNA提取
        4.2.3 PCR扩增
        4.2.4 序列测定
        4.2.5 数据分析
    4.3 结果
        4.3.1 种内序列多态
        4.3.2 群体动态历史研究
        4.3.3 群体遗传结构研究
    4.4 讨论
        4.4.1 遗传多态性研究
        4.4.2 群体动态历史研究
        4.4.3 群体遗传结构研究
第五章 长鲽群体遗传多样性与群体遗传结构研究
    5.1 前言
    5.2 材料与方法
        5.2.1 实验材料
        5.2.2 基因组DNA提取
        5.2.3 PCR扩增
        5.2.4 序列测定
        5.2.5 数据分析
    5.3 结果
        5.3.1 种内序列多态
        5.3.2 群体遗传结构分析
        5.3.3 遗传发育分析
    5.4 讨论
        5.4.1 遗传多态性研究
        5.4.2 群体遗传结构研究
第六章 基于线粒体DNA探讨文昌鱼属的系统发育关系
    6.1 前言
    6.2 材料与方法
        6.2.1 实验材料
        6.2.2 基因组DNA提取
        6.2.3 PCR扩增
        6.2.4 序列测定
        6.2.5 数据分析
    6.3 结果
        6.3.1 序列变异分析
        6.3.2 系统发育关系
    6.4 讨论
第七章 带鱼群体遗传结构与动态历史研究
    7.1 前言
    7.2 材料与方法
        7.2.1 实验材料
        7.2.2 基因组DNA提取
        7.2.3 PCR扩增
        7.2.4 序列测定
        7.2.5 数据分析
    7.3 结果
        7.3.1 种内序列多态
        7.3.2 遗传学关系
        7.3.3 群体历史动态
        7.3.4 群体遗传结构
    7.4 讨论
        7.4.1 遗传多态性研究
        7.4.2 群体动态历史研究
        7.4.3 群体遗传结构研究
第八章 总结
参考文献
致谢辞
在学期间发表的论文


【参考文献】:
期刊论文
[1]两种黄盖鲽线粒体DNA部分片段比较分析[J]. 张岩,肖永双,高天翔,于函.  水产学报. 2009(02)
[2]从线粒体控制区全序列变异看短颌鲚和湖鲚的物种有效性[J]. 唐文乔,胡雪莲,杨金权.  生物多样性. 2007(03)
[3]利用线粒体DNA控制区序列分析细鳞鲑种群的遗传结构[J]. 夏颖哲,盛岩,陈宜瑜.  生物多样性. 2006(01)
[4]黄海南部小黄鱼群体遗传多样性研究[J]. 许广平,仲霞铭,丁亚平,刘培庭,汤建华,许璞.  海洋科学. 2005(11)
[5]东海区小黄鱼空间格局的地统计学分析[J]. 张寒野,程家骅.  中国水产科学. 2005(04)
[6]文昌鱼秦皇岛、青岛和厦门地理种群形态特征的分化[J]. 闫路娜,左惠凯,曹玉萍.  动物学研究. 2005(03)
[7]南黄海族小黄鱼地方支族群洄游途径与环境关系的探讨[J]. 胡成建,张晶.  海洋渔业. 2005(02)
[8]鱼类线粒体DNA研究新进展[J]. 郭新红,刘少军,刘巧,刘筠.  遗传学报. 2004(09)
[9]通过Cyt b基因同源序列比较评估厦门文昌鱼的分类学地位[J]. 王义权,许群山,彭宣宪,周涵韬.  动物学报. 2004(02)
[10]昌黎海区文昌鱼初步调查[J]. 曹玉萍,闫路娜,谢松,刘震.  动物学杂志. 2001(03)



本文编号:3077514

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