奶牛产奶性状多组学研究及候选基因RRL8的功能验证
发布时间：2022-02-15 17:41
产奶性状是奶牛最为重要的经济性状,挖掘和筛选影响产奶性状的候选功能基因一直是奶牛遗传育种领域的研究热点。高通量组学技术快速发展,为奶牛产奶性状候选功能基因的筛选与鉴定提供了新途径。本研究基于多层次组学信息,从基因组、转录组和蛋白组水平挖掘产奶性状重要功能基因和调控元件,并对重要候选基因RPL8进行体外功能验证。研究共包括四部分试验:试验一:以9,615头中国荷斯坦牛为资源群体,利用测定日表型作为全基因组关联分析的反应变量,对1-3胎次产奶量、乳脂率和乳蛋白率三个性状进行纵向GWAS分析。结果发现84个SNP达到基因组显著水平,其中65个SNP位于已报道产奶性状相关QTL区间,最显著的位点位于DGAT1和GHR基因内部。对结果深入分析,发现1个新的值得进一步探究的显著影响乳脂率的QTL。该研究不仅充分证明了已报道的研究发现,也为产奶性状功能研究提供新资源。试验二:为了进一步从转录组水平挖掘和验证产奶性状的候选基因及调控元件,利用RNA-seq技术鉴定4头健康中国荷斯坦牛泌乳高峰期和泌乳末期乳腺组织中mRNA和lncRNA的变化。结果共发现了254个差异mRNA和117个差异lncRNA。...
【文章来源】：中国农业大学北京市211工程院校985工程院校教育部直属院校
【文章页数】：154 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－２２００６－２０１８年牛ＧＷＡＳ文章数量（截止到２０１８年３月１２日）??Ｆｉｇｕｒｅ?１?－２?Ｔｈｅ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｃａｔｔｌｅ?Ｇ?ＷＡＳ?ｆｒｏｍ?２００６?ｔｏ?２０１８（ｄｅａｄｌｉｎｅ?ｔｏ?Ｍａｒｃｈ?１２？?２０１８）??注：横坐标是年份，纵坐标是文窜的数Ｈ??
图I-3IncRNA分类Figure1-3ClassificationofIncRNAs〔来溉
证了?ｌｎｃＮＲＡｄ￡ＷＣ／？在抑制牛脂肪细胞分化中的调控机制，发现ＡＤＮＣＲ是与内ｍｉＲ－２０４竞争性结合，从而上调了?ｍｉＲ－２０４靶基因的表达，进而抑制脂肪细胞ａ／．?２０１６ｂ）?〇??蛋白质组与蛋白质组学??１蛋白质组与蛋白质组学概述??白质组（Ｐｒｏｔｅｏｍｅ）是蛋白质（Ｐｒｏｔｅｉｎ）与基因组（Ｇｅｎｏｍｅ）两个词的组合，指的是细胞的基因组所有表达的蛋白质的总和。根据中心法则（图１－５），遗传物质从ＤＮＡＮＡ，然后ＲＮＡ翻译成蛋白质，因此最终直接执行生物功能的是蛋白质，是生命功。因此蛋白质组是帮助我们理解生物系统调控的工具，对蛋白质结构和功能的研究机体在不同生理条件下功能变化的机制，有广泛和直接的研究前景。蛋白质ｏｍｉｃｓ）即是研究蛋白质组组成及其变化规律的科学，这个概念最早由Ｍａｒｃ?Ｗｉｋｉｎｓ提ｎｓ?ｅ；?ａ／．?１９９６）。蛋白质组学研究范围主要包括对细胞和组织内总蛋白的定性或定量研细胞内的定位、蛋白与蛋白、蛋白和ＤＮＡ的互作及翻译后修饰研究等（Ｔｙｅｒｓ?＆?Ｍ。??Ｃｅｎｔｒａｌ?ｄｏｇｍａ?Ｎｅｗ?ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ?Ｇｅｎｏｍｉｃ?ｈｙｐｏｔｈｅｓｉｓ??
【参考文献】：
期刊论文
[1]Depletion of ribosomal protein L8 impairs Drosophila development and is associated with apoptosis[J]. LI HongYan1,PAN LiXia2 & GOU KeMian1* 1State Key Laboratory for Agrobiotechnology,China Agricultural University,Beijing 100193,China;2School of Medicine,Tsinghua University,Beijing 100080,China. Science China（Life Sciences）. 2010(09)
本文编号：3627052
【文章来源】：中国农业大学北京市211工程院校985工程院校教育部直属院校
【文章页数】：154 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－２２００６－２０１８年牛ＧＷＡＳ文章数量（截止到２０１８年３月１２日）??Ｆｉｇｕｒｅ?１?－２?Ｔｈｅ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｃａｔｔｌｅ?Ｇ?ＷＡＳ?ｆｒｏｍ?２００６?ｔｏ?２０１８（ｄｅａｄｌｉｎｅ?ｔｏ?Ｍａｒｃｈ?１２？?２０１８）??注：横坐标是年份，纵坐标是文窜的数Ｈ??
图I-3IncRNA分类Figure1-3ClassificationofIncRNAs〔来溉
证了?ｌｎｃＮＲＡｄ￡ＷＣ／？在抑制牛脂肪细胞分化中的调控机制，发现ＡＤＮＣＲ是与内ｍｉＲ－２０４竞争性结合，从而上调了?ｍｉＲ－２０４靶基因的表达，进而抑制脂肪细胞ａ／．?２０１６ｂ）?〇??蛋白质组与蛋白质组学??１蛋白质组与蛋白质组学概述??白质组（Ｐｒｏｔｅｏｍｅ）是蛋白质（Ｐｒｏｔｅｉｎ）与基因组（Ｇｅｎｏｍｅ）两个词的组合，指的是细胞的基因组所有表达的蛋白质的总和。根据中心法则（图１－５），遗传物质从ＤＮＡＮＡ，然后ＲＮＡ翻译成蛋白质，因此最终直接执行生物功能的是蛋白质，是生命功。因此蛋白质组是帮助我们理解生物系统调控的工具，对蛋白质结构和功能的研究机体在不同生理条件下功能变化的机制，有广泛和直接的研究前景。蛋白质ｏｍｉｃｓ）即是研究蛋白质组组成及其变化规律的科学，这个概念最早由Ｍａｒｃ?Ｗｉｋｉｎｓ提ｎｓ?ｅ；?ａ／．?１９９６）。蛋白质组学研究范围主要包括对细胞和组织内总蛋白的定性或定量研细胞内的定位、蛋白与蛋白、蛋白和ＤＮＡ的互作及翻译后修饰研究等（Ｔｙｅｒｓ?＆?Ｍ。??Ｃｅｎｔｒａｌ?ｄｏｇｍａ?Ｎｅｗ?ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ?Ｇｅｎｏｍｉｃ?ｈｙｐｏｔｈｅｓｉｓ??
【参考文献】：
期刊论文
[1]Depletion of ribosomal protein L8 impairs Drosophila development and is associated with apoptosis[J]. LI HongYan1,PAN LiXia2 & GOU KeMian1* 1State Key Laboratory for Agrobiotechnology,China Agricultural University,Beijing 100193,China;2School of Medicine,Tsinghua University,Beijing 100080,China. Science China（Life Sciences）. 2010(09)
本文编号：3627052
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