小桐子干旱锻炼及空气干旱过程中microRNAome分析及部分重要miRNA的功能解析

发布时间：2024-03-31 08:11

　　小桐子,大戟科植物,是重要的能源植物之一,具有耐旱、耐贫瘠等优良性状,兼具抗癌抗菌等多种用途。随着全球气候变化,干旱对农业的威胁日益严重。弄清小桐子抗旱机制,获得抗旱候选基因是应对气候变化,因应粮食安全战略的有效手段之一。本实验室前期工作发现,空气干旱后小桐子幼苗中脯氨酸、甘氨酸甜菜碱、可溶性糖等渗透调节物质含量上升,从而使植物渗透势、水势降低,且叶片中上述渗透调节物质的含量均高于茎中。随后的研究工作表明,干旱锻炼提高小桐子幼苗的抗旱性,其生理生化机制是提高了前述渗透调节物质的含量,其中脯氨酸含量的提高是通过增加其合成代谢中各关键酶的活性,降低分解代谢中酶的酶活。在上述工作的基础上,本研究旨在探讨干旱锻炼之后小桐子快速适应干旱胁迫过程中,miRNA的作用机制。在实验室前期工作的基础上,选定15%PEG6000模拟干旱锻炼48 h,之后空气干旱72 h。在干旱锻炼0 h(CK)、6 h、12 h、24 h、48 h,及干旱胁迫在24 h、48 h、72 h取叶片,此外将正常生长48 h的材料,与处理材料同时进行空气干旱,72 h后取材作为另一对照(CK72)。以上处理重复3次,共得到27...

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【部分图文】：

图1-1miRNA的转录、加工、成熟及降解（引自Rogers等[17]）

第一章文献综述4miRNA的polyU尾可能是其降解的重要信号之一。miRNA的3’-末端也有polyA的情况。在欧洲大叶杨（Populustrichocarpa）中，部分miRNA3’-末端发现有polyA结构，且这一现象在茎尖、根尖和茎形成层中均存在，但在茎形成层中具poly....

图1-2miRNA作用机制

第一章文献综述6CSD2/miR398[29]。图1-2miRNA作用机制。miRNA有6种作用方式：a.翻译抑制，这种作用发生在定位到内质网的核糖体和mRNA聚合体上，同时还需要内质网上AMP1（ALTEREDMERISTEMPROGRAM1）蛋白的参与；b.转录本切割，miR....

图1-3本研究技术路线

第一章文献综述21图1-3本研究技术路线Figure1-3Theworkflowofthisresearch

图2-1模拟干旱锻炼样品H06-1（左）

第二章干旱锻炼及空气干旱过程中miRNA的变化25得到序列注释，以R语言DeSeq2[173]进行差异表达分析，所得序列与Rfam13.0[174]、数据库序列Blast比对去除tRNA、rRNA等数据，与miRBase21.0[175]比对获得KmiRNA注释信息，综合小桐子基....

本文编号：3943708