基于定量蛋白质组学研究食管癌细胞异常的蛋白质表达和翻译后修饰

发布时间：2023-03-31 20:38

　　食管癌(Esophageal carcinoma,EC)是十大恶性肿瘤之一,全世界每年约有30万人死于食管癌,其患者的五年生存率低于10%。从临床比例上看,食管鳞状细胞癌(Esophageal Squamous Cell Cancer,ESCC)是食管癌临床发病率最高的一种,占食管癌临床病例的90%。食管癌的发生具有很强的地域性,而我国则是它最主要的发生地之一,尤其是我国的农村,食管癌是发病率最高的恶性肿瘤之一,严重危害我国人民的身体健康。目前,对于食管癌的治疗还主要依靠外科手术,但食管癌患者在发现得病时大多处于晚期,因此对食管癌的治疗效果不佳。食管癌高发病率,低生存率和低发现率的主要原因是对其发生的原因以及癌症发展的分子机理认识不足。如果能够找到有效的肿瘤标志物或治疗靶点,将有助于提高食管癌的诊断率与治疗成功率。蛋白质作为生命功能的执行者,在癌症发展过程中具有举足轻重的地位。近几年,以质谱技术为基础的蛋白质组学正逐渐成为鉴定和定量蛋白质及翻译后修饰的有效研究手段。在本课题中,我们使用定量蛋白质组学方法对ESCC研究模型永生化的食管上皮细胞系SHEE和经SHEE诱导产生的食管癌细胞系S...

【文章页数】：163 页

【学位级别】：博士

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中文摘要
Abstract
缩略语
前言
    研究现状、成果
    研究目的、方法
一、食管鳞癌细胞的蛋白质组学研究
    1.1 对象和方法
        1.1.1 实验材料及试剂
        1.1.2 实验仪器
        1.1.3 实验所用计算机软件
        1.1.4 实验方法
        1.1.5 数据处理与生物信息学分析
    1.2 结果
        1.2.1 SHEEC与 SHEE细胞系状态验证
        1.2.2 蛋白质组的定性与定量
        1.2.3 蛋白质组定量数据与mRNA组定量数据的关联分析
        1.2.4 差异蛋白的筛选
        1.2.5 差异蛋白的生物信息学分析
    1.3 讨论
    1.4 小结
二、食管鳞癌细胞的蛋白质翻译后修饰组学研究
    2.1 对象和方法
        2.1.1 实验材料
        2.1.2 实验仪器
        2.1.3 实验方法
    2.2 结果
        2.2.1 赖氨酸乙酰化组的蛋白质组学分析
        2.2.2 磷酸化组的蛋白质组学分析
        2.2.3 赖氨酸琥珀酰化组的蛋白质组学分析
    2.3 讨论
    2.4 小结
三、食管鳞癌细胞组蛋白翻译后修饰研究
    3.1 实验方法
    3.2 结果
        3.2.1 食管癌细胞中组蛋白翻译后修饰的鉴定
        3.2.2 食管癌细胞中组蛋白翻译后修饰的定量分析
        3.2.3 二甲基化的上调与细胞迁移能力呈正相关
        3.2.4 组蛋白翻译后修饰调控酶与组蛋白修饰定量组的关联分析
        3.2.5 组蛋白短链酰化修饰的定量及其结合蛋白的研究
    3.3 讨论
    3.4 小结
全文结论
论文创新点
参考文献
发表论文和参加科研情况说明
附录
综述 蛋白基因组学分析策略和应用的研究进展
    综述参考文献
致谢
个人简历



本文编号：3775753