基于磷酸化组学技术发现弥漫型胃癌分子亚型与激酶靶点

发布时间：2024-03-17 17:39

　　弥漫型胃癌(diffuse-type gastric cancer,DGC)是胃癌临床病理学分型中预后最差的一种癌症,缺乏有效的分子靶向治疗药物。因此,有必要进一步揭示弥漫型胃癌的分子特征并筛选新的潜在药物靶点。我们采用磷酸化组学技术对83例弥漫型胃癌病人的癌组织与癌旁组织的磷酸化肽段进行富集分析与定量检测。经过数据的预处理与质量控制,采用无监督聚类算法发现弥漫型胃癌可在磷酸化位点水平进一步分为三个分子亚型(Ph1-3)。Ph1型病人的总体生存时间要明显好于另外两个亚型,Ph2和Ph3型病人的总体生存时间都较短。Ph2型病人对化疗较为敏感,Ph3型的病人对化疗不敏感。我们进一步采用激酶活性预测方法获得每个病人的激酶活性谱,并基于83例病人的激酶活性谱筛选到16个候选激酶靶点,这些激酶的活性与弥漫型胃癌的总体生存时间显著相关,集中在MTOR、cell cycle、MAPK与m RNA splicing等信号通路。此外,通过文献综述发现,目前对于临床组织样本的磷酸化组数据分析工作不够深入,没有充分发挥磷酸化组数据的独特优势。因此,我们以Clinical Proteomic Tumor An...

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【部分图文】：

图1.1全球胃癌每10万人发病频次图谱(Ajanietal.,2017)

第1章前言5一步以ClinicalProteomicTumorAnalysisConsortium(CPTAC)团队发表的高级别浆液型卵巢癌数据为例，总结出了磷酸化组数据分析策略，构建了磷酸化组数据的生物信息学分析流程，充分利用磷酸化组数据的信息，识别出活性与病人预后时间显著相关....

图1.2胃癌的劳伦分型(Chenetal.,2016b)

第1章前言7图1.2胃癌的劳伦分型(Chenetal.,2016b)以病理学为基础的劳伦分型将胃癌分为肠型(Intestinaltype)、弥漫型(Diffusetype)和混合型(Mixedtype)。1.3.1.2胃癌分子分型目前国际上研究胃癌分子分型的两大工作团队分别是TC....

图1.3TCGA团队与ACRG团队的胃癌分子分型与相应分子特征(CancerGenomeAtlasResearch,2014;CorsoandGiordano,2016;Cristescuetal.,2015)

第1章前言8微卫星稳定/间充质转换型(MSS/EMT,displayinglossofcadherin)，微卫星稳定/TP53阴性型(MSS/TP53–)(图1.3)。MSS/EMT亚型主要在年轻人中发病，诊断出来的时候一般已经是晚期，并且为弥漫型胃癌，属于预后最差的一类亚型，相....

图1.4弥漫型胃癌的蛋白质组分子分型(Geetal.,2018)

第1章前言10然杀伤细胞与巨噬细胞中。该课题组的蛋白质组层面研究工作让我们更清楚地从蛋白质层面了解弥漫型胃癌的亚型特征与潜在药物靶点，同时也是最早将蛋白质组的分子分型与病人临床预后关联的主要研究工作之一，为后续课题开展奠定了重要的工作基矗图1.4弥漫型胃癌的蛋白质组分子分型(Ge....

本文编号：3931394