两种不同生境中国沙棘种子内生细菌的多样性

发布时间：2023-05-10 18:37

　　植物内生菌广泛分布于植物的各种组织及器官中,对植物的生长表现出各种作用,而植物种子中的内生菌对植物的作用也越来越受到人们的关注。以榆中县和秦安县两种不同生境的中国沙棘种子为材料,分析中国沙棘种子内生细菌多样性,以期探究生境对种子内生菌多样性的影响,并为进一步研究种子内生菌与沙棘的相互作用提供依据。研究利用纯培养方法和高通量测序方法分别进行中国沙棘种子内生细菌多样性分析。对纯培养分离得到的内生细菌,利用16S rRNA基因序列分析法结合形态学特征进行内生细菌的鉴定;对高通量测序得到的数据进行基于OTUs(Operational Taxonomic units,可操作分类单元)的物种注释分析。通过纯培养方法从榆中县中国沙棘种子中分离得到4株内生细菌,分属于芽孢杆菌属(Bacillus)、葡萄球菌属(Staphylococcus)和假单胞菌属(Pseudomonas);秦安县中国沙棘种子中分离得到5株内生细菌,分属于芽孢杆菌属(Bacillus)、葡萄球菌属(Staphylococcus)和不动杆菌属(Acinetobacter)。采用高通量测序方法检测到榆中县中国沙棘种子内生细菌分属于7个...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验材料
        1.1.1 采样地概况
        1.1.2 主要设备与试剂
    1.2 实验方法
        1.2.1 沙棘种子内生细菌的纯培养
            (1)沙棘种子可培养内生细菌的分离与纯化
            (2)沙棘种子内生细菌的形态鉴定
            (3)沙棘种子内生细菌的分子鉴定
        1.2.2 沙棘种子内生细菌的高通量测序
2 结果与分析
    2.1 榆中县中国沙棘种子内生细菌多样性
        2.1.1 榆中县中国沙棘种子内生细菌的纯培养
            (1)内生细菌的形态特征
            (2)内生细菌的16S rRNA基因序列分析
        2.1.2 榆中县中国沙棘种子内生细菌的高通量测序
            (1)样品复杂度分析及OTUs数目统计
            (2)内生细菌群落结构组成
    2.2 秦安县中国沙棘种子内生细菌多样性
        2.2.1 秦安县中国沙棘种子内生细菌的纯培养
            (1)内生细菌的形态特征
            (2)内生细菌的16S rRNA基因序列分析
        2.2.2 秦安县中国沙棘种子内生细菌的高通量测序
            (1)样品复杂度分析及OTUs数目统计
            (2)内生细菌群落结构组成
    2.3 榆中县和秦安县两种不同生境中国沙棘种子内生细菌多样性比较
        2.3.1 内生细菌纯培养的差异
        2.3.2 内生细菌高通量测序的差异
            (1)内生细菌Alpha多样性指数分析
            (2)内生细菌Venn图分析
            (3)内生细菌群落结构组成分析
3 讨论



本文编号：3813283