基于SSR分子标记数据构建割手密核心种质库

发布时间：2023-08-06 12:20

　　以92份割手密初级核心种质为研究对象,利用SSR分子标记数据,依据Jaccard、SM和Nei&Li 3种遗传相似性系数逐步进行UPGMA聚类、多次抽样构建割手密核心种质库。结果显示:92份样本在15个SSR位点上呈现出丰富的多态性,共获得331个多态性条带,平均多态性条带比例达100%;利用3种遗传相似性系数和随机取样共获得5个核心种质库;Shannon–Wiener多样性指数、总条带数和多态性条带数3个指标在核心种质库代表性检验中呈现出较高的检测效率,其他6个指标检测效率相对较低;5个核心库中依据SM遗传相似性系数逐步构建的核心种质库质量最优,该库由80份样本组成,Nei’s多样性指数和Shannon-Wiener多样性指数分别为0.984 1和4.259 8,在P<0.05概率条件下与原库(分别为0.985 6和4.358 3)无显著差异,而且与原库的农艺性状均值差异百分率为0(<20.00%),极差符合率为99.16%(>80.00%)。研究认为,依据SM相似性系数,通过UPGMA聚类构建的80份割手密核心种质较好地代表了基础原始种质的分子水平和表型遗...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 叶片基因组总DNA提取与PCR扩增
        1.2.2 分子标记数据统计
        1.2.3 取样策略
2 结果与分析
    2.1 初级核心种质的遗传多样性
    2.2 核心种质的取样策略
    2.3 核心种质的代表性检测
3 结论与讨论



本文编号：3839410