狭叶柴胡β-amyrin合成酶基因的克隆及其蛋白的生物信息学分析

发布时间：2023-11-12 17:50

　　【目的】本文拟获得β-amyrin合成酶基因的全长序列及其蛋白的生物学信息。【方法】以狭叶柴胡为材料,获得了抗肝炎有效成分齐墩果酸合成关键酶—β-amyrin合成酶基因的cDNA序列,并应用生物信息数据库(哪个数据库)和分析软件(交代分析软件的类型)对该基因的保守序列、蛋白质理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位、二级结构、三级结构、磷酸化位点做了分析。【结果】β-amyrin合成酶基因的ORF核苷酸长度2289 bp,编码762个氨基酸,蛋白质序列中含有氧化鲨烯环化酶家族所特有的且高度保守的DCTAE、QW和MWCYCR 3个序列;BsAS无跨膜区,为亲水性蛋白,定位于细胞质中;其二级结构主要为α-螺旋和无规卷曲,三级结构预测结果可信。狭叶柴胡BsAS蛋白共有53个磷酸化位点,其中丝氨酸的磷酸化位点最多。【结论】本研究首次在狭叶柴胡中克隆了BsAS全长基因,同时利用生物信息学分析了其蛋白特性及细胞定位,该研究丰富了BsAS基因资源库,同时为齐墩果烷型代谢产物及代谢途径的深入研究奠定基础。

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 供试材料
    1.2 试剂
    1.3 试验方法
        1.3.1 BsAS全长序列扩增
            (1) BsAS基因中间片段的扩增。
            (2)BsAS基因5’端片段的扩增。
            (3)BsAS基因3’端片段的扩增。
            (4)BsAS全长基因的扩增。
        1.3.2 BsAS序列生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 狭叶柴胡中β-amyrin合成酶基因BsAS的克隆
    2.2 狭叶柴胡BsAS基因生物信息学分析
        2.2.1 BsAS保守序列分析
        2.2.2 狭叶柴胡BsAS理化性质分析
        2.2.3 狭叶柴胡BsAS跨膜区、亚细胞定位分析
        2.2.4 狭叶柴胡BsAS二级结构预测
        2.2.5 狭叶柴胡BsAS三级结构预测
        2.2.6 狭叶柴胡BsAS磷酸化位点预测
3 讨 论
4 结 论



本文编号：3863646