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黄金艾蒿的非靶向代谢组和转录组学分析

发布时间:2024-02-05 08:01
  目的:鉴定黄金艾蒿中次生代谢物质及其合成的关键基因。方法:通过非靶向代谢组学鉴定黄金艾蒿叶片中的次生代谢物质成分,利用转录组测序分析主要代谢成分合成途径的关键基因。结果:基于非靶向代谢组在黄金艾蒿叶片中鉴定出氨基酸类、生物碱类、奎宁酸及其衍生物类以及黄酮类等共98种代谢物,其中黄酮类物质有21种,包括圣草素、柚皮素、异鼠李素、异牡荆素以及芹菜素和山柰酚的糖苷衍生物等。基于转录组测序,经过de novo组装、去冗余后共获得45 494条Unigene,平均长度为702.17 bp, N50为830 bp。经过与公共数据库进行同源比对,共有36 866(81.03%)条Unigene获得功能注释,其中15 025(33.03%)条Unigene在KEGG数据库中得到注释,共涉及129个代谢通路。根据基因功能进一步鉴定到53个Unigene参与类黄酮的生物合成,包括黄酮类合成的关键酶PAL、CHS、CHI、F3H和FLS等。同时还鉴定到245个细胞色素P450家族基因和74个糖基转移酶家族基因。结论:该研究结果为下一步有针对性地研究黄金艾蒿的代谢物质活性和开展黄酮类化合物合成关键基因的功能研...

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【部分图文】:

图1黄金艾蒿Unigene的GO功能分类

图1黄金艾蒿Unigene的GO功能分类

表2Unigene的功能注释注释的数据库注释的数量百分比/%KOG2082545.78NR3604079.22Pfam2505455.07Swissprot2082445.77GO1990243.75KEGG1502533.....


图2黄金艾蒿Unigene的KEGG功能分类

图2黄金艾蒿Unigene的KEGG功能分类

根据KEGG数据库注释结果,黄金艾蒿Unigene主要分为五大类功能,包括代谢(metabolism,5041,49.89%)、有机系统(organismalsystems,235,2.33%)、遗传信息过程(geneticinformationprocessing,....



本文编号:3895910

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