不同发育时期亚麻茎秆中木质素积累相关miRNA及其靶基因的挖掘分析

发布时间：2024-04-11 22:26

　　【目的】深入挖掘分析亚麻茎秆不同发育时期木质素积累相关的miRNA及其靶基因,为解析亚麻纤维层木质素动态积累提供理论依据。【方法】以双亚4号(低木质素)和NEW(高木质素)花后20、30和40 d的茎秆为试验材料,基于miRNA测序和降解组测序结果分析miRNA转录水平动态变化及其靶基因注释功能,并采用实时荧光定量PCR检测2个亚麻品种间表达差异最显著的miRNA及其靶基因的表达模式。【结果】构建双亚4号和NEW花后20、30和40 d茎秆的miRNA文库,从中鉴定出305个miRNA,包括143个保守的miRNA和162个新鉴定的miRNA,且这些miRNA的靶基因不同转录本并非均受miRNA调控。将鉴定的305个miRNA与亚麻基因组序列信息进行靶基因预测,结果鉴定出286个miRNA的4807个靶基因,另外19个miRNA未预测到靶基因。通过对降解组测序数据进行整合分析,共获得21个miRNA的97个靶基因,共检测到97个降解位点,仅占鉴定出亚麻茎秆中miRNA靶基因总数(4807个)的2%,仍有大量的靶基因未被鉴定。对降解组中被降解的97个靶基因进行功能注释,发现有22个与植物...

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 试验方法
        1.2.1 mi RNA文库构建及测序分析
        1.2.2 降解组c DNA文库构建及测序分析
        1.2.3 实时荧光定量PCR验证
    1.3 统计分析
2 结果分析
    2.1 mi RNA转录水平分析结果
    2.2 降解组测序分析结果
    2.3 实时荧光定量PCR验证结果
3 讨论
4 结论



本文编号：3951235