新疆野苹果和栽培苹果特异性SSR标记开发及应用

发布时间：2021-09-23 08:33

　　根据全基因组测序已完成的栽培苹果基因组,设计、筛选针对新疆野苹果的特异性SSR引物。通过PCR扩增、基因测序筛选了15对可以在新疆野苹果和栽培苹果中扩增出稳定性高且具备多态性目的条带的特异性SSR引物;其中8对仅能在栽培苹果中扩增出特异性目的条带。15对特异性SSR引物对新疆野苹果和栽培苹果不同居群的SSR分析表明,新疆野苹果遗传多样性较为丰富,与栽培苹果不同居群分化程度较为显著,基因流水平较低。聚类分析表明,这15对特异性SSR引物可以将新疆野苹果和栽培苹果不同居群清晰区分。本研究利用新开发的SSR引物不仅可以揭示新疆野苹果和栽培苹果的遗传多样性和系统发育关系,对初步了解SSR变异位点的生物学功能以及丰富新疆野苹果和栽培苹果基因组的认识也有一定的作用,从而为更好地有效利用相关资源提供研究基础。 

【文章来源】：江苏农业科学. 2020,48(21)

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
        1.1.1 样品调查采集
        1.1.2 试剂和仪器
    1.2 试验方法
        1.2.1 DNA提取
        1.2.2 SSR引物设计
        1.2.3 PCR扩增
    1.3 数据处理和分析
2 结果与分析
    2.1 SSR引物PCR扩增分析
    2.2 新疆野苹果、栽培苹果遗传分化和SSR位点多态性分析
    2.3 新疆野苹果和栽培苹果系统发育分析
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]新疆野苹果叶形性状变异及其与SSR标记关联分析[J]. 左力辉,张文林,邱彤,张军,杨敏生.  园艺学报. 2015(04)
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[3]基于ITS和matK序列探讨新疆野苹果与中国苹果的系统演化关系[J]. 朱元娣,曹敏格,许正,王昆,张文.  园艺学报. 2014(02)
[4]中国新疆野苹果天然群体遗传多样性SSR分析[J]. 董研,张军,任亚超,韩志校.  植物遗传资源学报. 2013(05)
[5]新疆野苹果资源遗传多样性SSR分析[J]. 秦伟,沙红,刘立强,廖康,耿文娟,王云.  果树学报. 2012(02)
[6]新疆苹果种质资源亲缘关系的SSR分析[J]. 秦伟,刘立强,廖康,耿文娟,唐芳.  新疆农业科学. 2011(01)
[7]天山西部新疆野苹果种群特征[J]. 刘华,臧润国,丁易,张炜银,郭仲军,白志强,刘双成.  林业科学. 2010(11)
[8]新疆野苹果研究进展[J]. 张艳敏,冯涛,张春雨,何天明,张小燕,刘遵春,王艳玲,束怀瑞,陈学森.  园艺学报. 2009(03)
[9]新疆野苹果群体遗传结构和遗传多样性的SRAP分析[J]. 张春雨,陈学森,林群,苑兆和,张红,张小燕,刘崇祺,吴传金.  园艺学报. 2009(01)
[10]新疆发生苹果小吉丁虫[J]. 王春晓,赵健桐,隋建中,赵福,马福杰.  新疆农业科学. 1995(05)

博士论文
[1]天山马鹿种群数量，遗传结构，家域及系统发育关系研究[D]. 周璨林.新疆大学 2015



本文编号：3405387