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基于叶绿体片段序列的苹果属植物遗传多样性

发布时间:2021-10-14 19:23
  从叶绿体基因水平上研究中国原产苹果属植物的遗传多样性以及不同种在不同区域范围的单倍型的系统进化关系,为其起源演化、保护和利用提供依据。基于叶绿体基因间区trnH-psbA、trnS-trnG spacer+intron、trnT-5′trnL和5′trnL-trnF,对来源于12个省区的722份苹果属植物种质进行序列分析,4个区域合并之后片段长度为4 120 bp,共有579个多态性变异位点和100个单倍型,核苷酸多样性(Pi)和单倍型多样性(Hd)分别为0.009 52和0.879,两者最高的区域为trnH-psbA(Hd=0.808,Pi=0.034 09)。Tajima′s D检验中,4个cpDNA区域合并后的Tajima′s D值为-1.503 16,在P>0.10检测水平上不显著,遵循中性模型。AMOVA分析表明,遗传变异主要存在于种群间和种内居群内。单倍型分布及网络结构分析结果表明,邻接网络中心位置的缺失单倍型闭合成环,苹果属不同种具有不同的演化路线,各个种间以及同种种质在不同地域起源演化过程中具有错综复杂的关系,相对古老的单倍型H6和H

【文章来源】:华北农学报. 2020,35(06)北大核心CSCD

【文章页数】:10 页

【文章目录】:
1 材料和方法
    1.1 试验材料
    1.2 DNA提取及PCR扩增
    1.3 数据统计与分析
2 结果与分析
    2.1 苹果属植物叶绿体DNA变异
    2.2 苹果属植物的遗传分化
    2.3 苹果属植物种群历史变化动态分析
    2.4 苹果属植物单倍型分布
        2.4.1 第一支系单倍型分布
        2.4.2 第二支系单倍型分布
        2.4.3 第三支系单倍型分布
        2.4.4 第四支系单倍型分布
    2.5 苹果属植物种群遗传关系
3 讨论
    3.1 苹果属植物遗传多样性
    3.2 苹果属植物起源演化分析


【参考文献】:
期刊论文
[1]新疆野苹果叶绿体DNA变异与遗传进化分析[J]. 高源,王大江,王昆,丛佩华,张彩霞,李连文,朴继成.  植物遗传资源学报. 2020(03)
[2]新疆野苹果资源类型表型性状鉴定及优异资源的初步筛选[J]. 刁永强,许正,闫鹏,陈淑英,张学超,刘君.  经济林研究. 2019(01)
[3]7个来源地区山荆子的遗传多样性与群体结构分析[J]. 高源,王昆,王大江,赵继荣,张彩霞,丛佩华,刘立军,李连文,朴继成.  中国农业科学. 2018(19)
[4]我国苹果属资源现代分布调查初报[J]. 王大江,王昆,高源,赵继荣,刘立军,龚欣,李连文.  植物遗传资源学报. 2017(06)
[5]新疆野苹果(Malus sieversii(Ledeb.) M.Roem.)植物学性状遗传多样性及相关性分析[J]. 闫鹏,韩立群,梅闯,刁永强,许正,张学超,马凯,艾沙江·买买提,王继勋.  植物遗传资源学报. 2016(04)
[6]高等植物DNA条形码最新研究进展及其应用[J]. 付涛,王志龙,钱萍仙,李文,袁冬明,严春风.  核农学报. 2016(05)
[7]药用植物叶绿体基因组研究进展[J]. 倪梁红,赵志礼,米玛.  中药材. 2015(09)
[8]基于ITS和matK序列探讨新疆野苹果与中国苹果的系统演化关系[J]. 朱元娣,曹敏格,许正,王昆,张文.  园艺学报. 2014(02)
[9]我国苹果属(Malus Mill.)野生资源研究利用的现状分析[J]. 张新忠,王忆,韩振海.  中国农业科技导报. 2010(03)
[10]新疆野苹果群体遗传结构和遗传多样性的SRAP分析[J]. 张春雨,陈学森,林群,苑兆和,张红,张小燕,刘崇祺,吴传金.  园艺学报. 2009(01)

博士论文
[1]基于分子标记技术的部分苹果属植物分类地位及亲缘关系研究[D]. 徐榕雪.南京林业大学 2018
[2]泰沂山区苹果属植物系统学研究[D]. 李慧峰.沈阳农业大学 2012



本文编号:3436708

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