基于C-mii工具的长春花miR156序列及前体序列识别与预测

发布时间：2023-02-15 20:15

　　MicroRNA是一种18～22 nt的内源性非编码RNA,在植物的诸多代谢途径中起到调控作用,其中,miR156家族是植物生长发育及次生代谢过程重要调控因子。本研究采用C-mii工具,利用药用植物基因组资源数据库提供的长春花转录组数据,对潜在的成熟miR156序列及其前体结构进行识别和预测。最终得到21个miRNA家族的识别结果,共574条miRNA预测序列,其中miR156家族共4个成员,筛选得到2个miR156家族成熟序列和前体序列二级结构,分别命名为Cro-miR156a及Cro-miR156c。

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【文章目录】：
0 引 言
1 实 验
    1.1 数据库及工具
    1.2 方 法
        1.2.1 同源搜索
        1.2.2 初级miRNA折叠
        1.2.3 前体miRNA折叠及人工筛选
2 结果与讨论
    2.1 同源搜索结果
    2.2 初级miRNA折叠结果
    2.3 前体miRNA及人工筛选折叠结果
    2.4 前体序列BLAST验证与讨论
    2.5 Cro-miR156靶位点预测及检验
3 结 论



本文编号：3743775