古田山花臭蛙和华南湍蛙比较景观遗传学研究

发布时间：2022-07-15 16:59

　　两栖动物是森林生态系统中重要的组成部分,对生态系统的物质循环和能量流动起到至关重要的作用;两栖动物也是脊椎动物从水生到陆生的重要过渡类群,其生活史周期离不开水、皮肤通透性高等特点使其对栖息地环境变化极其敏感。因此,两栖动物是森林生态环境质量监控的理想指示物种,其群落结构特征也是评价该地区生态系统质量的重要参数。本研究以古田山国家级自然保护区内同域分布的花臭蛙与华南湍蛙为研究对象,采用微卫星分子标记的方法,对种群的遗传多样性和遗传结构进行对比分析,并结合景观遗传学方法,优化最小费用距离模型,实现景观连接度的定量分析和潜在廊道的准确定位,在生物多样性保护和自然保护区管理规划方面提供更为可靠的科学依据。本文主要研究结果如下:1、利用高通量测序的方法,从华南湍蛙基因组中开发了12对具有多态性的微卫星标记。使用一个华南湍蛙野生群体（26个）对通过筛选的微卫星标记的种群遗传学特征进行评价。共检测到92个等位基因,等位基因数分布范围为2～19,平均为7.67;观测杂合度分布范围为0.423～1.000,平均为0.808;期望杂合度分布范围为0.510～0.945,平均0.755;多态信息含量分布范围... 

【文章页数】：76 页

【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
    1 景观遗传学
        1.1 背景
        1.2 景观遗传学的概念
        1.3 景观遗传学的研究方法
        1.4 景观遗传学与连接度
        1.5 景观遗传学在两栖类中的研究现状
        1.6 景观遗传学在其他动物中的研究现状
    2 研究地与研究物种概述
        2.1 研究地概述
        2.2 研究物种概述
    3 研究目的与意义
第二章 基于高通量测序的华南湍蛙微卫星标记开发与评价
    1 引言
    2 实验材料
        2.1 样本采集
        2.2 主要实验试剂和实验仪器
    3 实验方法
        3.1 DNA提取
        3.2 高通量测序和微卫星位点查找
        3.3 引物的设计与筛选
        3.4 微卫星标记的种群遗传学评价
    4 实验结果
        4.1 华南湍蛙DNA的提取结果
        4.2 引物的设计与筛选结果
        4.3 微卫星标记的种群遗传学评价
    5 讨论
        5.1 微卫星引物的设计与筛选
        5.2 华南湍蛙群体的种群遗传学特征
        5.3 高通量测序法获取微卫星序列的优越性
第三章 古田山花臭蛙和华南湍蛙遗传多样性与遗传结构
    1 引言
    2 实验材料
        2.1 样本采集
        2.2 主要实验试剂和实验仪器
    3 实验方法
        3.1 DNA提取
        3.2 PCR群体扩增
        3.3 基因分型与数据读取
        3.4 数据分析
    4 实验结果
        4.1 DNA提取与PCR扩增结果
        4.2 基因分型与数据读取结果
        4.3 数据分析结果
    5 讨论
        5.1 种群遗传多样性
        5.2 种群遗传分化和遗传结构
第四章 古田山花臭蛙和华南湍蛙种群景观连接度分析
    1 引言
    2 实验材料
    3 实验方法
        3.1 景观数据
        3.2 最小成本距离模型
        3.3 遗传数据
        3.4 确定最佳模型
    4 实验结果
        4.1 景观数据
        4.2 遗传数据
        4.3 最佳模型
        4.4 生态廊道
    5 讨论
第五章 小结和展望
参考文献
附录
攻读学位期间参加的科研项目及成果
致谢



本文编号：3662470