脑缺血大鼠模型的转录组学研究

发布时间：2021-04-06 22:20

　　目的研究脑缺血大鼠与正常大鼠在基因表达方面的差异。方法将16只雄性大鼠随机分为正常组、模型组,采用线栓法制备大鼠左侧脑缺血模型,进行RNA-seq测序。结果两组之间存在530个差异基因,其中包括37个显著差异基因和98个极显著差异基因。基因本体（GO）分析发现,生物学过程和分子功能部分相关基因整体呈现上调趋势,细胞组分相关的基因既有显著上调趋势也有显著下调趋势;通过基因和基因组京都百科全书数据库（KEGG）通路分析发现,P53信号通路相关基因显著下调,而固醇激素生物合成通路相关基因则显著上调。结论脑缺血的形成可能与细胞凋亡、突触后密度有很大关系,P53信号通路的下调、类固醇激素生物合成通路的上调可能影响脑缺血的形成。 

【文章来源】：国际药学研究杂志. 2019,46(06)北大核心

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验动物
    1.2 试剂
    1.3 分组及动物造模
    1.4 TTC染色
        1.4.1 TTC溶液配制
        1.4.2 脑组织切片
        1.4.3 染色并观察
    1.5 HE染色
        1.5.1 脱蜡
        1.5.2 染色
        1.5.3 脱水、透明、封固
    1.6 组织取材及RNA测序
    1.7 生物信息分析
2 结果
    2.1 脑组织TTC染色结果
    2.2 HE染色结果
    2.3 测序数据质量评估
    2.4 基因表达丰度统计
    2.5 差异基因统计
    2.6 GO富集分析
    2.7 KEGG通路分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]脑缺血再灌注损伤细胞凋亡机制的研究进展[J]. 彭智远,刘旺华,曹雯.  中华中医药学刊. 2017(08)
[2]风味甜瓜中柠檬酸代谢研究进展及RNA-seq技术应用现状[J]. 汤谧,刘晔,任俭,张娜,曾红霞,程维舜,李煜华,孙玉宏.  长江蔬菜. 2016(24)
[3]脂肪干细胞对脑缺血损伤大鼠氧化应激反应的抑制作用[J]. 沈英杰,陈红梅,房艳.  解剖科学进展. 2015(04)
[4]PSD-95与脑缺血的关系及其调控机制研究[J]. 刘颖异,胡玲芹,张映,李方钦,王静,潘玉君.  现代生物医学进展. 2014(09)
[5]基于新一代高通量测序的环境微生物转录组学研究进展[J]. 蔡元锋,贾仲君.  生物多样性. 2013(04)
[6]转录组研究新技术:RNA-Seq及其应用[J]. 祁云霞,刘永斌,荣威恒.  遗传. 2011(11)

博士论文
[1]基于RNA-Seq技术的雏鸵鸟胸腺应答硼刺激分子机制研究[D]. 肖珂.华中农业大学 2016

硕士论文
[1]大鼠脑缺血模型评价及大鼠脑缺血慢性期GFAP、NSE、SYN、Nogo-A表达与神经功能转归的相关性[D]. 刘世民.南昌大学 2011



本文编号：3122258