盐城地区柯萨奇病毒A组16型分离株VP1区基因分子生物信息学分析

发布时间：2021-04-22 15:08

　　目的分析盐城地区柯萨奇病毒A组16型（coxsackievirus A16,CVA16）VP1区蛋白结构和B细胞表位。方法基于盐城地区2017年CVA16分离株J837 VP1区蛋白序列,采用分子生物信息学软件预测蛋白质理化特性、亲水性、二级结构和抗原表位等。结果盐城地区CVA16分离株VP1区编码蛋白为亲水蛋白,无信号肽,有1个跨膜螺旋区域,二级结构以无规则卷曲为主,存在7个潜在的B细胞抗原表位。结论本文成功预测了CVA16分离株VP1区蛋白二级结构和B细胞优势表位,为CVA16疫苗研研发提供了科学依据。 

【文章来源】：现代预防医学. 2019,46(21)北大核心

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 CVA16分离株VP1序列的获取
    1.2 生物信息学软件
2 结 果
    2.1 氨基酸组成
    2.2 蛋白质理化性质分析
    2.3 信号肽分析
    2.4 疏水性分析
    2.5 跨膜螺旋预测
    2.6 磷酸化位点预测
    2.7 糖基化、脂酰化等修饰位点预测
    2.8 蛋白质二级结构
    2.9 B细胞表位预测
3 讨 论


【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3153989