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成都某部一起感染Yamagata系乙型流感病毒血凝素基因分析

发布时间:2022-01-23 06:51
  目的分析成都某部感染乙型流感病毒遗传进化与血凝素(HA)基因突变位点。方法通过犬肾上皮细胞(MDCK细胞)体外分离患者咽拭子标本流感病毒毒株,用PCR获取乙型流感病毒HA基因并测序,与NCBI数据库在线比对并利用MEGA 6.06软件构建系统发育进化树,分析突变位点。结果通过MDCK细胞接种,分离出1株乙型流感病毒株,以感染病例咽拭子核酸及分离毒株的核酸为模板进行PCR扩增得到1 755 bp全长HA基因,获得的序列提交至GenBank数据库,获得基因登录号为MH236281。通过在线比对及系统发育树构建,该病例感染的病毒为Yamagata系乙型流感病毒。与乙型流感病毒Yamagata系的代表毒株Influenza B/Yamagata/16/88(GenBank No. M36105)相比,HA基因点突变碱基为57个;与世界卫生组织(WHO)推荐的疫苗株Influenza B/Utah/08/2014 (Gen Bank No. KU592766)相比,突变碱基数为20个。进一步对HA1氨基酸突变位点进行分析,与四川地区往年流行株相比均发生了不同程度的突变,其中与2010年四川温江的... 

【文章来源】:第二军医大学学报. 2019,40(11)北大核心CSCD

【文章页数】:8 页

【部分图文】:

成都某部一起感染Yamagata系乙型流感病毒血凝素基因分析


乙型流感病毒的分离培养Fig2IsolationandincubationofinfluenzaBvirus图

序列,流感,病毒,内核


?嵛坏惴⑸?吮湟欤?直鹞?L176Q和M255V,这2个位点均不在乙型流感病毒HA1上的抗原决定簇区域内。值得一提的是,HA1的176位点是一个全新的突变,以往四川流行毒株、Yamagata系的代表毒株InfluenzaB/Yamagata/16/88(GenBankNo.M36105)及WHO推荐的疫苗株InfluenzaB/Utah/08/2014(GenBankNo.KU592766)的HA1176位点均为亮氨酸(leucine,L),而本研究病例感染的乙型流感毒株HA1176位点突变为谷氨酰胺(glutamine,Q),其突变意义仍有待深入研究。图3免疫荧光检测乙型流感病毒感染的MDCK细胞内核蛋白表达Fig3ImmunofluorescencedetectionofnucleoproteinexpressioninMDCKcellsinfectedwithinfluenzaBvirusMDCK:Madin-Darbycaninekidney.Originalmagnification:×10010102103VirusgradientdilutionFig2IsolationandincubationofinfluenzaBvirusOriginalmagnification:×100图3免疫荧光检测乙型流感病毒感染MDCK细胞内核蛋白表达Fig3ImmunofluorescencedetectionofnucleoproteinexpressioninMDCKcellsinfectedwithinfluenzaBvirusMDCK:Madin-Darbycaninekidneycell.Originalmagnification:×100以感染病例咽拭子和分离毒株提取的病毒核酸为模板,均可扩增出大小为1755bp的目的片段(图4),二者测序序列一致,提交至,二者测序序列一致,提交至GenBank数据库,获得数据库,获得GenBank登录号为MH236281。Fig2IsolationandincubationofinfluenzaBvirusOriginalmagnification:×100图3免疫荧光检测乙型流感病毒感染MDCK细胞内核蛋白表达Fig3ImmunofluorescencedetectionofnucleoproteinexpressioninMDCKcells

电泳图,流感,病毒,电泳图


为MH236281。Fig2IsolationandincubationofinfluenzaBvirusOriginalmagnification:×100图3免疫荧光检测乙型流感病毒感染MDCK细胞内核蛋白表达Fig3ImmunofluorescencedetectionofnucleoproteinexpressioninMDCKcellsinfectedwithinfluenzaBvirusMDCK:Madin-Darbycaninekidneycell.Originalmagnification:×100以感染病例咽拭子和分离毒株提取的病毒核酸为模板,均可扩增出大小为1755bp的目的片段(图4),二者测序序列一致,提交至GenBank数据库,获得GenBank登录号为MH236281。图4乙型流感病毒HA基因PCR产物电泳图Fig4ElectrophoresisofPCRproductoftheinfluenzaBHAgeneHA:Hemagglutinin;M:Marker;1:Throatswabnucleicacidastemplate;2:Isolatedvirusstrainnucleicacidastemplate图5基于HA基因的系统发育进化树Fig5PhylogeneticevolutionarytreebasedontheHAgeneThe20171123(MH236281)isthesequenceobtainedinthisstudy.ThenumbersinparenthesesindicatetheaccessionnumberinGenBank.Thenumberateachbranchpointsisthepercentagesupportedbybootstrap.Bar:0.01sequencedivergence.HA:Hemagglutinin图4乙型流感病毒HA基因PCR产物电泳图Fig4ElectrophoresisofthePCRproductoftheinfluenzaBHAgeneagglutinin;M:Marker;1:Throatswabnucleicacidastemplate;2:Isolatedvirusstrainnucleicacidastemplate病毒HA基因系统发育进化树HA基因核酸序列构建系统发育进化树,结果如图5所示,本研究感染病例HA基ankNo.MH236281)均与Yamagata系的代表毒株InfluenzaB/Yamagata/16/88No.M36105)处在相同的进化分枝上,而与Victoria系的代表毒株Influenz

【参考文献】:
期刊论文
[1]今年我国流感流行的深度解析[J]. 周密,李雷雷,毛晨梅,胡必杰.  中华医院感染学杂志. 2018(04)



本文编号:3603827

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