辽宁省间日疟原虫裂殖子表面蛋白1基因型及同源性分析

发布时间：2023-04-02 02:50

　　目的分析近10年辽宁省输入性及本地感染间日疟病例的疟原虫裂殖子表面蛋白1(PvMSP-1),并对其进行基因型别BLAST比对和同源性进化树分析。方法收集2008-2018年的间日疟病例样本,提取疟原虫基因组DNA,根据基因ICB5-ICB6区间片段设计引物,进行巢氏PCR扩增、测序、序列的比对以及同源性分析。结果共分析31份间日疟核酸样本,其中Sal-1型有13份,片段位置在470 bp左右,Belem型有18份,片段位置在400 bp左右。将所得出的目标产物送上海维基基因测序公司进行测序,经进化树的比对分析,31份样本中Sal-1型有13份,Belem型有5份,Ⅲ型的样本有13份。PvMSP-1基因ICB5-ICB6片段存在高度多态性,DNA序列可以结合流行病学调查来确定感染的来源。结论辽宁省在近10年当中输入性及本地感染的PvMSP-1基因型有Sal-1型、Ⅲ型和Belem型,优势基因型为Sal-1型和Ⅲ型。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样本采集
    1.2 主要试剂
    1.3 实验方法
    1.4 测序与同源性的比对
2 结果
    2.1 显微镜下间日疟原虫的形态
    2.2 PvMSP-1基因分型
    2.3 构建基因进化树
    2.4各基因型代表株核苷酸的同源性比较
3 讨论



本文编号：3778381