与食管上皮细胞DNMT1高表达相关的LncRNA共表达网络分析

发布时间：2023-04-11 01:56

　　目的:筛选并初步鉴定与参与相关信号通路的DNMT1高表达相关的LncRNA,为深入探讨疾病机制提供理论依据。方法:以前期构建的食管上皮DNMT1高表达细胞株为实验组(3例),正常食管上皮细胞株HEEC为对照组(3例),利用Agilent Human LncRNA V5芯片检测DNMT1高表达和正常细胞株的LncRNA和mRNA的差异表达,以Fold Change≥2.0,P<0.05为标准进行显著差异的筛选;实时荧光定量聚合酶链反应(Real-time PCR)SYBR Green验证差异倍数较大的10条LncRNA;采用基因本体(GO)功能注释分析法和KEGG通路分析法,对差异表达的mRNA进行功能注释与分析;根据KEGG结果挑选出6条信号通路进行LncRNA-mRNA共表达网络分析。结果:1、显著差异表达的LncRNA共有6987个,其中表达上调的有3654个,表达下调的有3333个;显著差异表达mRNA共有7421个,表达上调的2254个,表达下调的5167个。2、qRT-PCR验证筛选出的10个LncRNAs,全部与芯片结果吻合,分别为:lnc-OR1M1-1:1,lnc...

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【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
前言
研究内容与方法
    1 研究对象
    2 内容与方法
        2.1 主要试剂
        2.2 主要仪器
        2.3 主要器材
        2.4 研究方法
    3 质量控制
    4 统计分析
    5 技术路线
结果
讨论
小结
致谢
参考文献
综述
    参考文献
攻读硕士学位期间发表的学术论文
导师评阅表



本文编号：3789114