黄牛全基因组分析及肌肉发育相关基因剂量效应研究

发布时间：2022-12-03 20:10

　　基因组上的遗传变异是研究动物表型性状差异的重要基础。目前，在牛上已有多个品种的全基因组变异信息被公布，并且通过生物信息学分析，预测出了很多与家畜肌肉生长、脂肪代谢、繁殖力和抗病性等数量性状相关的位点。然而，中国黄牛的全基因组变异研究尚未见报道。关于全基因组变异检测的方法主要有SNP（Single nucleotidepolymorphism）芯片、CGH（Comparative genomic hybridization）芯片和高通量测序等，其中，高通量测序技术能够全面、准确的获取基因组上的全部遗传信息，因而应用较为广泛。本研究采用测序技术系统检测了2个中国地方黄牛品种（南阳牛和秦川牛）的基因组变异，并比较分析两个品种间、中国地方黄牛与国外牛品种基因组DNA上的差异。同时，研究拷贝数变异（Copy number variation, CNV）对功能基因的表达及相关性状的影响，最后，深入分析了牛配对盒7（Paired box7, Pax7）基因启动子区的一处短片段拷贝变异对启动子活性、基因表达和表型性状所产生的剂量效应。本研究主要取得了如下结果： 1.黄牛全基因组变异检测及分析 ... 

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能够引起转录水平变化的基因组变异类型(HaraksinghandSnyder2013)

每兆碱基对（Mbp）序列测序所需成本变化(Delsenyetal.2010)

拷贝数变异的不同类型Figure1-3Differenttypesofcopynumbervariations此外，研究表明，CNVs在基因组中的分布也是有一定规律的，Hou等(2011)研究

【参考文献】：
期刊论文
[1]Identification and expression analysis of mical family genes in zebrafish[J]. Chikin Kuok.  遗传学报. 2010(10)
[2]秦川牛选育工作的过去、现在和未来[J]. 邱怀.  黄牛杂志. 1999(01)
[3]建国以来我国养牛业发展概况[J]. 邱怀.  西北农林科技大学学报(自然科学版). 1984(03)



本文编号：3706892