基于生物通路和蛋白质相互作用网络对重度抑郁症相关易感基因的分析

发布时间：2023-10-07 19:25

　　研究目的:重度抑郁症(Major depressive disorder;MDD)是由遗传、环境和心理等多种因素共同作用而引起的复杂性精神系统障碍疾病。随着全球抑郁症患者的不断增加,重度抑郁症已经成为仅次于人类心脏病的第二大疾患,它不仅严重影响患者的健康和生活,也给家庭和全社会都带来了沉重的负担。探索抑郁症发病的分子机理,是开发预防和治疗此类疾病的药物及治疗方法的基础。近年来,已经通过候选基因的遗传关联研究或在全基因组关联研究鉴定了许多可能与MDD具有遗传相关性的基因。然而,在许多情况下,这些基因及基因间的相互作用在MDD发病过程中的作用仍不清楚。本研究将试图对与MDD具有遗传相关性的基因进行系统全面的分析。我们通过筛选人类遗传关联研究收集MDD显著相关的易感基因,然后基于功能分析和通路串话分析揭示与这些基因相关的生物过程,探索疾病涉及的通路模块及其通路之间的关系。此外,在人类蛋白质相互作用组的背景下构建了MDD特异性子网络,该网络进一步提供了与MDD相关的基因之间关系的更多信息,并引入了可能与该疾病相关的新基因。总之,基于通路和网络的方法探索了系统生物学水平上MDD发病的分子机制。另...

【文章页数】：114 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
中文摘要
abstract
缩略语/符号说明
一、前言
    1.1 研究背景
        1.1.1 重度抑郁症
        1.1.2 阿尔茨海默氏症
        1.1.3 MDD与 AD的共患病现状研究
    1.2 功能富集分析
    1.3 蛋白质相互作用网络分析
    1.4 研究目的及意义
    1.5 研究内容及方法
    1.6 论文创新点
    1.7 论文结构安排
二、原理和方法
    2.1 数据收集
        2.1.1 疾病易感基因
        2.1.2 AD易感基因和其他基因
        2.1.3 蛋白质相互作用数据集
    2.2 富集分析方法
    2.3 通路串话分析
    2.4 蛋白质互作网络拓扑分析
    2.5 疾病特异性子网络构建
    2.6 基于通路和网络的方法比较MDD和 AD
        2.6.1 显著通路的富集分析
        2.6.2 MDD和 AD蛋白质互作网络的比较分析
        2.6.3 预测潜在共病易感基因
三、结果与分析
    3.1 疾病易感基因
        3.1.1 MDD易感基因
        3.1.2 AD易感基因
    3.2 GO富集分析
    3.3 通路富集分析
    3.4 通路串话分析
    3.5 PPIN拓扑特性分析
    3.6 构建特异性子网络
    3.7 基于通路和网络的方法比较MDD和 AD
        3.7.1 MDD与 AD基因的比较
        3.7.2 通路富集分析比较
        3.7.3 网络拓扑特性的比较
        3.7.4 MDD和 AD风险基因的预测
四、结论与讨论
    4.1 结论
        4.1.1 功能富集分析
        4.1.2 MDD特异性子网络的分析
        4.1.3 基于通路和网络对MDD和 AD的比较
    4.2 讨论
    4.3 本研究的不足之处
参考文献
附录
    附录1 MDD易感基因集
    附录2 AD易感基因集
    附录3 MDD基因集富集的316 条显著性BP
    附录4 MDD基因富集的73 条显著性通路
    附录5 AD基因富集80 条显著性通路
综述
    综述参考文献
致谢
个人简历



本文编号：3852356