人类疱疹病毒8型K12/T0.7亚型与新疆Kaposi肉瘤的相关性研究

发布时间：2023-05-14 06:52

　　目的：明确新疆KS感染HHV-8的k12/T0.7基因亚型的分类，初步探讨HHV-8k12/T0.7亚型与新疆KS不同临床分型及临床表现的相关性。 方法：使用酚-氯仿-异戊醇法对新疆维吾尔自治区人民医院收集的30例KS石蜡包埋组织进行HHV-8DNA抽提，并使用巢式PCR扩增k12/T0.7基因片段并双向测序，采用DNAMAN软件把测序结果装配成重叠；然后使用Clustal W软件对该重叠群进行序列比对，再采用PHYLIP软件包对比对结果进行系统发生学分析，从而确定HHV-8k12/T0.7基因的亚型分类；最后运用Fisher确切概率法对结果进行统计学分析。 结果：1.30例新疆KS中22例HHV-8感染为阳性，阳性率为73.33%，其中7例AIDS-KS患者HHV-8感染均为阳性，阳性率为100%；2.基于k12/T0.7基因位点进行系统进化树分析发现：分为两种亚型A和A/C，其中10例为A亚型，12例为A/C型；3.新疆HHV-8各病毒株k12/T0.7基因核苷酸序列（407bp）间的差异性为0～0.35%，A亚型和C亚型病毒株k12/T0.7核苷酸序列间差异性为0.16%～0.3...

【文章页数】：50 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
英文缩略语表
前言
材料与方法
    1 材料
        1.1 组织标本的收集
        1.2 试剂来源
        1.3 实验溶液配制
        1.4 PCR 引物来源
        1.5 主要的实验仪器设备
    2 方法
        2.1 病毒 DNA 提取
        2.2 巢式 PCR 扩增
        2.3 电泳鉴定
        2.4 双向测序
        2.5 DNA 序列编辑
        2.6 系统发生学分析
        2.7 参照的核苷酸序列 GenBank 编码
    3 数据处理
结果
    1. KS 的临床表现及组织学特点
    2. k12/T0.7 基因位点扩增产物电泳结果
    3. k12/T0.7 基因位点 PCR 产物测序结果
    4. 实验所需的参考序列（灰色部分为本研究扩增片段区）
    5. 系统进化树
    6. HHV-8 k12/T0.7 基因核苷酸序列和氨基酸序列之间的差异性
    7. HHV-8 k12/T0.7 基因亚型与新疆 KS 相关因素的关系分析
讨论
    1. 新疆 KS 及其感染 HHV-8 的流行病学状况
    2. 新疆 KS 感染 HHV-8 的 k12/T0.7 基因亚型
    3. HHV-8 k12/T0.7 基因亚型与新疆 KS 临床损害的相关性
    4. HHV-8 k12 基因亚型与新疆 KS 临床类型的相关性
    5. HHV-8 k12 基因亚型与新疆 AIDS-KS 发病的相关性
    6. 小结
结论
参考文献
文献综述
    参考文献
附 1 新疆 KS 患者临床资料及感染的 HHV-8 k12 基因亚型情况一览表
致谢
作者简介
石河子大学硕士研究生学位论文导师评阅表



本文编号：3817405