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银屑病患者与健康人肠道菌群的比较研究

发布时间:2024-04-02 19:04
  目的:应用16S rRNA测序对银屑病患者以及健康对照组肠道菌群特征进行分析和比较,初步探讨银屑病患者肠道菌群结构及多样性特征,为寻找银屑病病因及新的治疗方法提供依据。方法:收集2019年7月至2020年1月间就诊的符合纳入标准的银屑病患者(P组)及在本院进行健康体检人群(C组)的新鲜粪便标本。共纳入12例银屑病患者及12例健康人。采用CTAB法提取粪便细菌总DNA,PCR扩增,用Illumina Nova Seq平台测序,测序后进行OTUs聚类,并对其进行物种注释及组间差异分析。结果:1.两组在性别、年龄及BMI指数无统计学差异(P>0.05)。2.经OTU聚类共获得1225个OTU,521个两组共有,293个P组特有,408个C组特有。3.α-多样性分析显示,研究样本量足,两组肠道菌群丰度无统计学差异(P>0.05)。4.β-多样性分析显示,两组间菌群结构有统计学差异(P<0.05)。5.LEf Se分析发现,13个物种的丰度在组间有差异。P组增加的主要有巨单胞菌属(megamonas)、大肠杆菌(escherichia coli)和韦荣球菌科(veillonel...

【文章页数】:39 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

图1韦恩图

图1韦恩图

11结果1一般临床资料本研究纳入的12例银屑病患者以及12名健康对照者,在性别、年龄、BMI指数上无统计学差异(P均>0.05)。2物种注释2.1OTU数目对得到的有效序列以97%相似度进行OTUs聚类分析,两组样本共获得1225个OTU,其中P组获得个814个OTU,C组获得9....


图2门水平上两组样本的物种相对丰度Fig.2therelativespeciesabundanceatphylumlevel

图2门水平上两组样本的物种相对丰度Fig.2therelativespeciesabundanceatphylumlevel

12歧杆菌目(bifidobacteriales);在科水平上的优势物种为毛螺旋菌科(lachnospiraceae)、拟杆菌科(bacteroidaceae)、消化链球菌科(peptostreptococcaceae);在属水平上的优势物种为类杆菌(bacteroides)、a....


图3科水平上两组样本的物种相对丰度

图3科水平上两组样本的物种相对丰度

12歧杆菌目(bifidobacteriales);在科水平上的优势物种为毛螺旋菌科(lachnospiraceae)、拟杆菌科(bacteroidaceae)、消化链球菌科(peptostreptococcaceae);在属水平上的优势物种为类杆菌(bacteroides)、a....


图4属水平上两组样本的物种相对丰度Fig.4therelativespeciesabundanceatgenuslevel

图4属水平上两组样本的物种相对丰度Fig.4therelativespeciesabundanceatgenuslevel

13Fig.3therelativespeciesabundanceatfamilylevel图4属水平上两组样本的物种相对丰度Fig.4therelativespeciesabundanceatgenuslevel3物种多样性分析3.1样本复杂度分析(alphadiversit....



本文编号:3946063

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