高加索人群白癜风易感位点与汉族人相关性研究

发布时间：2017-08-08 09:20

  本文关键词：高加索人群白癜风易感位点与汉族人相关性研究

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【摘要】：研究背景白癜风（Vitiligo，OMIM：#193200）是一种获得性，由受累区域的皮肤、毛发和粘膜的黑素细胞减少或缺失导致的进行性、多灶性色素脱失性皮肤病。多个基因和环境因素在白癜风的发病中起重要作用。不同地区和种族的发病率不同，全世界的发病率为0.1%~2.9%，而中国汉族人的发病率约为0.19%。白癜风的发病机制涉及很多学说，如黑素细胞自毁学说、生物学说、神经学说、自身免疫学说和遗传学说等，但它们仅仅能解释小部分白癜风病例。一些临床和流行病学研究提示白癜风遵循多基因或多因子遗传模式。白癜风的家族聚集性导致白癜风患者的一级亲属发病率增加和同卵双胞胎共患率增加。此外，约1/4的白癜风患者伴有其他自身免疫性疾病，而且他们的亲属比一般人群更易患自身免疫性疾病。这些相关的免疫性疾病包括免疫性甲状腺疾病、2型糖尿病、系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、艾迪生病、恶性贫血和银屑病等。通过全基因组方法已鉴定出了很多白癜风易感基因，但仅有少数的易感位点在后来的实验中得到验证，可能与白癜风的遗传异质性相关。 近期在高加索人群中进行的两项全基因组关联研究（GWAS）发现了90多个与白癜风易感性相关的SNP点。为了验证这些SNP点与中国汉族人白癜风的相关性，根据这些SNP点在中国人群的最小等位基因频率（MAF）和连锁不平衡（LD）特征，我们选择了分别位于16q24.3、8q24.22、19p13.3、22q13.2、12q24.12、3q13.33、10q25.3、7p21.3、3p13、4p16.1和11p13的11个SNP位点（rs9926296、rs853308、rs6510827、rs4822024、rs4766578、rs4330287、rs3814231、rs2192346、rs17008723、rs16872571、rs10768122）进行基因分型研究。 目的研究分别位于16q24.3、8q24.22、19p13.3、22q13.2、12q24.12、3q13.33、10q25.3、7p21.3、3p13、4p16.1和11p13的SNP点（rs9926296、rs853308、rs6510827、rs4822024、rs4766578、rs4330287、rs3814231、rs2192346、rs17008723、rs16872571、rs10768122）与汉族人白癜风易感的相关性。 方法利用Sequenom MassArray基因分型系统在1977例白癜风患者和2024例正常人对照中进行分型分析，得出分型数据，用SPSS13.0和Plink1.03软件进行统计分析。 结果1.病例组与对照组的11个SNPs点的等位基因和基因型分布差异均无统计学意义（P0.05）。2.有家族史患者与无家族史患者的11个SNPs点的等位基因频率分布差异均无统计学意义（P0.05）。3.患者发病年龄≤20岁组和发病年龄＞20岁组相比较：rs9926296A等位基因频率在发病年龄≤20岁组明显高于发病年龄＞20岁组(19.91%vs11.51%，，P=0.03797，OR=1.745，95%CI：1.025-2.2972)；rs9926296基因型在两组间分布差异无统计学意义（P=0.065）；患者发病年龄≤20岁组与健康对照组比较：rs9926296等位基因频率和基因型在两组间分布差异均无统计学意义（P0.05）；患者发病年龄20岁组与健康对照组比较：rs9926296等位基因频率和基因型在两组间分布差异均无统计学意义（P0.05）。 结论1.中国汉族人白癜风与高加索人群的白癜风易感基因可能无相关性。2.rs9926296可能与中国汉族人群白癜风早发患者（≤20岁）发病相关。3.高加索人群与中国人白癜风易感基因存在异质性。
【关键词】：白癜风 单核苷酸多态性 中国汉族人 高加索人群
【学位授予单位】：安徽医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：R758.41
【目录】：

• 英文缩略词表6-7
• 中文摘要7-9
• Abstract9-12
• 1 引言12-14
• 2 材料与方法14-34
• 2.1 调查表的设计14
• 2.2 相关调查内容的定义14-15
• 2.2.1 发病年龄14
• 2.2.2 发病程度14-15
• 2.2.3 发病类型15
• 2.2.4 家族史15
• 2.2.5 伴发自身免疫性疾情况15
• 2.3 研究对象15-16
• 2.4 调查资料的筛选及收集、录入过程中质量控制方法16-17
• 2.4.1 调查资料的筛选16
• 2.4.2 临床资料收集、录入过程中质量控制方法16-17
• 2.5 实验试剂17-18
• 2.5.1 DNA 提取试剂17
• 2.5.2 电泳试剂17
• 2.5.3 DNA 标准化试剂17
• 2.5.4 基因分型试剂17-18
• 2.6 实验仪器18-20
• 2.6.1 DNA 提取器材18-19
• 2.6.2 电泳仪器19
• 2.6.3 DNA 标准化仪器19
• 2.6.4 基因分型仪器19-20
• 2.7 分析软件和电子数据库查询信息20
• 2.8 试验方法和步骤20-34
• 2.8.1 基因组 DNA 的制备20-22
• 2.8.2 SNP 点选择22-23
• 2.8.3 引物设计及合成23-28
• 2.8.4 基因分型28-33
• 2.8.5 Plink1.03 软件进行统计分析33-34
• 3 结果34-41
• 3.1 一般情况34
• 3.2 基因型-表型分析结果34-36
• 3.3 11 个 SNPs 位点与临床表型之间的比较36-41
• 4 讨论41-43
• 5 结论43
• 6 参考文献43-48
• 附录48-50
• 致谢50-51
• 课题综述51-61
• 参考文献57-61

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前2条

1 张峥;肖风丽;杜文辉;周伏胜;方巧云;杨森;张学军;;中国汉族人白癜风伴发自身免疫疾病与遗传关系[J];安徽医科大学学报;2008年02期

2 ;白癜风临床分型及疗效标准(2003年修订稿)[J];中华皮肤科杂志;2004年07期

本文编号：639249