RCCS模拟微重力对人角化细胞代谢组学的影响

发布时间：2021-11-22 22:53

　　目的探讨旋转式细胞培养系统（RCCS）模拟微重力对人永生化角质形成细胞系（HaCaT）细胞代谢组学的影响。方法应用RCCS建立模拟微重力细胞培养系统,体外培养HaCaT细胞,随机分为模拟微重力组（SMG组）和正常重力组（NG组）,细胞培养1、2、3 d后收集样本,进行LC/MS代谢组学分析。结合正交偏最小二乘法（O-PLS-DA）和两样本独立t检验寻找两组细胞的差异代谢物,将差异代谢物输入KEGG数据库,进行代谢通路的构建与功能分析。结果 LC/MS代谢组学分析结果显示,与NG组比较,SMG组HaCaT细胞在RCCS模拟微重力环境中培养1 d后共有74种差异代谢物,其中16种表达上调,58种表达下调;2 d后共有89种差异代谢物,其中15种表达上调,74种表达下调;3 d后共有100种差异代谢物,其中23种表达上调,77种表达下调;以表达有统计学差异（VIP>1且P<0.05）的49种代谢物作为目标代谢标记物,其中鞘氨醇、谷氨酸、二十二碳五烯酸下调,脱水山梨糖醇等物质表达上调。KEGG分析显示,其涉及的代谢通路有氨基酸代谢、脂质代谢、细胞增殖和凋亡、物质转运、分解代谢、信号... 

【文章来源】：解放军医学杂志. 2019,44(09)北大核心CSCD

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 主要材料及仪器
    1.2 细胞培养及分组
    1.3 RCCS微载体培养
    1.4 样本采集
    1.5 样品处理
    1.6 U H P LC-LTQ-M S分析条件
    1.7 数据分析
    1.8 统计学处理
2 结果
    2.1 主成分分析
    2.2 偏最小二乘法判别分析
    2.3 差异代谢物的筛选与鉴定
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]旋转细胞培养系统模拟微重力环境对小鼠成纤维细胞lncRNA表达的影响[J]. 王占宇,姜福全,徐冰心,宋向卫,司少艳,周金莲,杨鹤鸣,李成林,崔彦.  解放军医学杂志. 2017(10)



本文编号：3512599