八肋游仆虫中编程性核糖体移码基因的鉴定及其分子机制研究

发布时间：2024-01-30 03:09

　　蛋白质的合成是所有生物体中的基本生命过程。核糖体维持正确的读框对于蛋白质的合成至关重要,一旦发生移码,将会导致截短的或无义蛋白的生成,从而造成翻译能量的损耗,加重细胞清除及质控机制的负担。然而,在某些特殊情况下,翻译中的核糖体能够在mRNA的特定位置,从起始的0读框转换到-1或+1读框,然后继续进行翻译,这一过程被称作编程性核糖体移码(programmed ribosomal frameshifting,PRF)。PRF现象首次在病毒中发现,随后越来越多的证据表明该现象普遍存在于从细菌到真核生物等生命进化的各个分支。前期基于单个基因的研究显示游仆虫中具有高频率的+1 PRF现象。本研究对八肋游仆虫(Euplotes octocarinatus)的大核基因组及转录组进行了测序分析,从基因组水平对这一特殊现象及其分子机制进行了深入探讨。此外,还通过质谱分析对预测的PRF基因加以验证。所得结果如下:1.利用Illumina测序平台对八肋游仆虫大核基因组进行测序,共得到约11 Gb原始数据;将低质量reads过滤后,采用meta-assembly的拼接策略进行基因组组装,将组装结果中来自于细菌...

【文章页数】：125 页

【学位级别】：博士

图1.1蛋白质合成示意图