基于转录组测序的胀果甘草抗逆相关基因分析

发布时间：2024-03-27 19:35

　　土地盐碱化严重影响农作物的生长,了解植物抗逆机理并筛选抗逆相关基因对抗逆植物分子育种具有重要的意义。本实验室前期研究发现,胀果甘草(Glycyrrhiza inflata)根诱导产生的愈伤组织具有一定的耐盐性。对盐处理之后的愈伤组织进行转录组测序,获得了胀果甘草转录组数据。本研究基于胀果甘草转录组数据,对注释为胚胎发育晚期丰富蛋白(late embryogenesis abundant protein,LEA)、NAC转录因子(NAC transcription factor,NAC)和富集脯氨酸蛋白(proline-rich proteins,PRPs)基因进行生物信息学分析,对筛选得到的差异表达基因进行基因表达模式分析,对GiLEA₃-1、GiNAC06、GiPRP3进行基因功能分析。主要研究结果如下:(1)胀果甘草LEA、NAC、PRPs基因生物信息学分析从盐胁迫胀果甘草转录组中鉴定出20个LEA家族基因以及1个上调的LEA差异表达基因、86个胀果甘草NAC转录因子基因和14个NAC差异表达基因、5个PRPs家族基因以及3个PRPs差异表达基因。序列比对分析...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图2.1胀果甘草与拟南芥LEA家族基因构建进化树

12图2.1胀果甘草与拟南芥LEA家族基因构建进化树Figure2.1PhylogenetictreeconstructedbyLEAfamilygenefromGlycyrrhizainflataandArabidopsisthaliana将胀果甘草与拟南芥NAC家族基因进行序....

图2.2胀果甘草与拟南芥NAC家族基因构建的进化树

15图2.2胀果甘草与拟南芥NAC家族基因构建的进化树Figure2.2PhylogenetictreeconstructedbyNACfamilygenefromGlycyrrhizainflataandArabidopsisthaliana将胀果甘草PRPs家族基因与拟南芥、....

图2.3胀果甘草PRPs家族基因与拟南芥、水稻、大豆基因构建的系统进化树

16图2.3胀果甘草PRPs家族基因与拟南芥、水稻、大豆基因构建的系统进化树Figure2.3PhylogenetictreeconstructedbyPRPsfamilygenesofGlycyrrhizainflataandArabidopsis，riceandsoybean....

图2.4胀果甘草中LEA家族基因Motifs预测结果

18图2.4胀果甘草中LEA家族基因Motifs预测结果注:A：胀果甘草LEA家族基因所含Motifs序列图；B：胀果甘草LEA家族基因Motifs分布图Figure2.4PredictionresultsoftheLEAfamilygeneMotifsinGlycyrrhiza....

本文编号：3940388