西瓜裂刻叶基因ClLL1的精细定位及克隆

发布时间：2024-04-20 01:14

　　叶缘裂刻是植物适应环境(尤其是逆境)的一种表现,在生产上有很多应用优势,例如提高植物的抗旱、抗寒及对强风的抵御能力。西瓜是葫芦科重要的经济作物,其叶形为裂刻叶。开展对西瓜叶型调控基因的精细定位与克隆的研究,对认识叶形发育及改良西瓜抗旱品种具有重要意义。本研究以西瓜商品种“1101”自交获得的分离群体为材料,观察了叶形的形态学特征,遗传分析表明西瓜叶缘裂刻是由单基因控制的显性性状,命名为ClLL1(Citrullus lanatus Lobed Leaf 1);通过BSR-seq技术,完成对叶缘裂刻基因ClLL1精细定位,确定ORF5(Cla018360)为候选基因,并对其进行生物信息学分析及克隆。主要取得以下结果:1.群体叶片形态统计发现,叶片形状在第三片真叶出现以后就可明显区分,在第六片真叶期有显著差异。此外,第六片真叶期后,全缘叶植株中可观察到明显的对称状边缘突起。2.F_2:3群体植株自交,每株单独收种,构建可用于叶缘性状遗传分析与基因定位的F_3:4群体。以小比例F_3:4子代统计叶缘形态的分离情况,结果显示,F

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图3-1西瓜裂刻叶和全缘叶叶片表型a.裂刻叶和全缘叶幼苗叶形比较b.F3:4：全缘叶，红色箭头所指为叶缘褶皱而非裂刻；裂刻叶c.F3:4全缘叶和裂刻叶植株第1-10片真叶比较Fig.3-1Phenotypesofleafshapesinwatermelon....

图3-2西瓜裂刻叶性状ClLL1基因的定位A.ClLL1基因的初定位

图3-2西瓜裂刻叶性状ClLL1基因的定位A.ClLL1基因的初定位。标记后括号中的数字为重组体的数量。B.ClLL1基因的精细定位。C.标记W07164和W07061之间重组体的基因型。等位基因简写为：A：裂刻叶纯合子B：全缘叶纯合子C：杂合子Fig.....

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图3-5三种材料Cla018360基因的氨基酸序列比对图红框表示HDdomain，绿框表示LZmotifFig.3-5AlignmentsoftheaminoaidsequenceofCla018360fromdifferentmateria....

图3-4三个基因组ORF1和ORF5的核苷酸多态性黑色方块表示碱基缺失

图3-4三个基因组ORF1和ORF5的核苷酸多态性黑色方块表示碱基缺失Fig.3-4NucleotidepolymorphismsofORF1andORF5amongthreewatermelongenomes.Theblackreprese....

本文编号：3958655