利用Meta分析挖掘玉米在非生物和生物胁迫诱导下的核心响应基因

发布时间：2024-04-27 00:46

　　玉米是世界第一大粮食作物,在全球的饲料作物和工业原料作物中也占有非常重要的地位。玉米在我国种植区域广泛,种植地区之间的气候差异较大。作为固着生物,环境胁迫很大程度上会抑制作物的产量。由于气候变暖导致极端气候的增加以及病虫害对于作物的胁迫,迫切需要开发出能够抵御多种胁迫的品种。然而,我们对于玉米如何广泛地应对不同胁迫的响应机制的了解还很有限。本研究中通过对公共数据库中可以获得的玉米6种非生物胁迫以及4种生物胁迫的转录组数据进行Meta分析,以鉴定玉米在非生物和生物胁迫下的核心响应基因。主要结果如下:1.对玉米在经受干旱3天、干旱6天、冷胁迫、热胁迫、低氮胁迫、盐胁迫这6种非生物胁迫的转录表达情况进行分析,分别鉴定到1208、1246、3218、1668、2662、1411个差异表达基因。接着利用Meta分析,综合每个基因在6种胁迫下的P值以及胁迫处理后表达的差异倍数,共鉴定到425个非生物胁迫核心响应基因(metaDEG);同样,对玉米在经受蚜虫、粘虫、尾孢菌、炭疽刺盤孢菌屬这4中生物胁迫的转录组进行分析,分别鉴定到682、383、1986、433个差异表达基因。接着对这4中生物胁迫下基...

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图1-1试验技术路线图

沈阳农业大学硕士学位论文19理解玉米如何在不同环境胁迫下进行响应的机制，并可以应用于遗传育种中提高玉米在环境胁迫中的耐受性。本研究的技术路线见图1-1。图1-1试验技术路线图Figure1-1Theexperimentaltechnologyroadmap

图2-1在不同非生物条件下玉米差异表达基因的数量Figure2-1Numberofdifferentexpressiongenesinmaizeunderdifferentabioticstress

第二章非生物和生物胁迫下核心响应基因（metaDEG）的鉴定22上调表达的差异表达基因和697个下调表达的差异表达基因。在热胁迫下有1206个上调表达的差异表达基因和1456个下调表达的差异表达基因。在盐胁迫下有816个上调表达的差异表达基因和595个下调表达的差异表达基因。对玉....

图2-2在不同生物条件下玉米差异表达基因的数量Figure2-2Numberofdifferentexpressiongenesinmaizeunderdifferentabioticstress

沈阳农业大学硕士学位论文23图2-2在不同生物条件下玉米差异表达基因的数量Figure2-2Numberofdifferentexpressiongenesinmaizeunderdifferentabioticstress注：横轴为生物胁迫的类型，纵轴为对应每种胁迫下的差异表达....

图2-3非生物胁迫和生物胁迫下metaDEG的数量Figure2-3NumberofmetaDEGunderabioticandbioticstress

第二章非生物和生物胁迫下核心响应基因（metaDEG）的鉴定24Zm00001d020780）与物质的转运（Zm00001d044442和Zm00001d019228）有关。有15个基因在生物胁迫和非生物胁迫中均下调表达，其中9个基因（Zm00001d006193、Zm00001....

本文编号：3965106