寡肽的结构性质分析以及高效的结构搜索策略的研究

发布时间：2024-03-10 07:50

　　寡肽不仅是构成蛋白质的片段,同时在生物体体内也能形成独立功能的小分子,具有极为重要的研究价值。特别是对这些小分子的结构及性质的分析,是认识蛋白质功能的多样性的基础,从而引起了当代科研工作者的广泛兴趣。在文中,借助于分子轨道理论和密度泛函理论等常见的量化计算方法,我们选取了多类寡肽结构体系,研究了多个代表性方向,最后,对实验光谱解析、金属离子络合以及高效的结构搜索策略等方面给出了一系列创新性的见解。具体而言,本博士学位论文主要围绕气相二肽在多光子共振谱中的非平衡态转化对最终光谱解析的影响,二肽与碱/碱土金属的络合特征以及如何高效的搜索寡肽势能面的特征构型三个大方向来分析展开,下面来简单地介绍各章节的主要内容。第一章首先简约介绍和回顾了用于分子体系计算研究的主要理论与方法,包括多种从头计算方法,密度泛函理论方法和半经验方法,同时也罗列了基函数的相关概念和振动光谱计算的一些基本知识。最后,对本论文研究所用到的主要计算软件进行了简要介绍。第二章主要描述了氨基酸和多肽分子的定义以及对其研究的重要性,并简单地介绍了目前国际上对本文内容相关领域的实验及理论方面的研究现状。同时,本章也概括和分析目前研...

【文章页数】：130 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图1.2自治方法求解HF方程的流程图

：??ＥｖｌＡｖ?＿?ｅＡｖ］ｃｕｖ?＝?〇；?ｕ＝１，…，Ｋ；?ｉ＝１＇…，Ｋ?（１１８）??式中??Ｆｕｖ?＝?ｈｕｖ?＋?Ｇｕｖ?（１１９）??Ｕ?＝?／；只⑴；Ｔｖ⑴叫?（１．２０）??Ｇｕｖ?＝?ｌ＾＇Ｚｖｉｌ．ｊＣａｊＣ＾ｌＫｕｖ＾ｒｉ）?－?（ＵＴ］＼＾Ｖ）］?（１....

图1.3Levy变分原理的示意图，摘自文献[8]0

定理二很容易得到证明，如图１．３所示，基态能对应??Ｅ〇?＝密度与波函数是对应的，所以??［Ｐ（ｒ〇］?＝?Ｆ［ｐ］?＋?ＪＶ（ｒ）Ｖ（ｒ）ｄｒ?２?巧０｜／？｜％〉＝?Ｅｙ?［ｐ〇］?＝?Ｆ［ｐ］?＝?Ｔ［ｐ）＋Ｅｅｅ［ｐ］同时也提供了一种计算基态能量与相应的电子密度的变分ａｎ....

图１．４自洽法求解ＫＳ方程的流程图

?（１．４４）??方程（１．４３）在形式上与Ｈａｒｔｒｅｅ－Ｆｏｃｋ方程类似，求解的方式也是运用迭代的??方法（如图１．４所示），得到方程的解｛也｝，进而便可进一步求解体系对应的基??态的电子密度与与之对应的能量值。其中，解得的ＫＳ轨道与ＨＦ轨道的形??状也很类似，通常可将其看成....

图２．３激光感应荧光光谱的原理示意图，摘自文献［１４］

?Ｂ??图２．４共振多光子电离的原理示意图，摘自文献［１４］。??共振多光子电离谱是研宄光与物质相互作用的重要方法，具有较高的探测灵??敏度且能够提供能级信息，广泛运用于气相寡肽的单分子光谱测量、同位素分离、??分析化学以及里德堡态等领域的研究。与单光子吸收不同，如图２．４所示，....

本文编号：3924471