中国多中心侵袭性感染光滑念珠菌复合体流行病学及棘白菌素耐药机制研究

发布时间：2024-04-26 05:11

　　目的:综合评估基因水平和蛋白水平技术对光滑念珠菌复合体菌种的鉴定能力;分析中国多中心侵袭性感染光滑念珠菌复合体的抗真菌药物敏感性;系统性研究光滑念珠菌的分子流行病学特征及对棘白菌素类药物的耐药机制。方法:本研究选取了2009年8月至2014年7月五年参加CHIF-NET的11家监测中心收集的所有非重复侵袭性感染光滑念珠菌411株及所有参与医院收集的12株尼瓦利亚念珠菌(Candidanivariensis)和1株布加拉念珠菌(Candida bracarensis)。比较表型方法、基因测序和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对光滑念珠菌复合体的鉴定能力,并在菌种准确鉴定的基础上,测定菌株对9种抗真菌药物的最低抑菌浓度(MIC)。分子流行病学方面,利用多位点序列分析(MLST)和微卫星检测方法,对411株光滑念珠菌进行分子分型,并进行聚类及同源性分析;此外,收集CHIF-NET 2015所有血流感染分离的光滑念珠菌158株,剖析PDR1和MSH2两个耐药相关基因在临床菌株中的突变率并分析其与氟康唑敏感性、分子型别的关系。耐药机制研究方面,检测411株光滑念珠菌F...

【文章页数】：128 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图１．１１家参与单位地理分布和收集的菌株数量（括号内）??Ｆｉｇｕｒｅ?１．?Ｇｅｏｇｒａｐｈｉｃ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｔｈｅ?１１?ｓｔｕｄｙ?ｃｅｎｔｅｒｓ?ｉｎｖｏｌｖｅｄ?ｉｎ?ｔｈｉｓ?ｓｔｕｄｙ?ａｎｄ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ??ｉｓｏｌａｔｅｓ?ｃｏｌｌｅｃｔｅｄ?ｉｎ?ｅａｃｈ?ｃｅｎｔｅｒ?（ｓｈｏｗｎ?ｉｎ?ｂｒａｃｋｅｔｓ）??

本研宄纳入的２００９年８月１日至２０１４年７月３１日，１１家监测中心五年期间共分离??侵袭性感染光滑念珠菌４１１株，占总体分离的酵母菌的９．５％，每年分离的菌株数在??７６－９５株之间，各单位收集的菌株数量见图１。??＾?＾７ｈ１?（２９）?＂Ｈ４Ｖ１２Ｉ??参??４?＇＂ｆ．?....

图３．尼瓦利亚念珠菌与布加拉念珠菌ＩＴＳ序列最大似然树??Ｆｉｇｕｒｅ?３．?Ｔｈｅ?ｍａｘｉｍｕｍ－ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ?ｔｒｅｅ?ｏｆ?Ｃａｎｄｉｄａ?ｎｉｖａｒｉｅｎｓｉｓ?ａｎ?

得到序列号（表６）。根据ＩＴＳ和Ｄ１／Ｄ２测序结果，结合两种菌在Ｇｅｎｂａｎｋ中的??其它序列，以白念珠菌ＡＴＣＣ?１８８０４的序列作为树根，分别作两种菌ＩＴＳ和Ｄ１／Ｄ２序??列最大似然比树状图（图３和图４）。ＩＴＳ结果显示，１２株尼瓦利亚念珠菌可分为两??组（Ｇｒｏｕｐ?１和....

图６．?Ｂｒｕｋｅｒ?ＣｌｉｎｐｒｏＴｏｏｌｓ模型遗传算法（ＧＡ）生成最大分辨能力的五个峰，红色为尼瓦??利亚念珠菌，绿色为布加拉念珠菌??Ｆｉｇｕｒｅ?６．?Ｆｉｖｅ?ｐｅａｋｓ?ｗｅｒｅ?ｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄ?ｂｙ?ｔｈｅ?ｇｅｎｅｔｉｃ?ａｌｇｏｒｉｔｈｍ?（ＧＡ）?ｔｏ?ｐｒｏｖｉｄｅ?ｔｈｅ?ｈｉｇｈｅｓｔ??ｓｅｐａｒａｔｉｏｎ?ｐｏｗｅｒ?ｔｏ?ｇｅｎｅｒａｔｅ?ａ?ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉ?

ＧＡ交叉验证值（特异性）均为１００％，ＳＮＮ和ＱＣ的特异性分别为９９．１６％和９９．５８％。??Ｂｒｕｋｅｒ?ＣｌｉｎｐｒｏＴｏｏｌｓ模型遗传算法（ＧＡ）生成最大分辨能力的五个峰。ＧＡ设定：??模型的最大峰值数，５；最大代数，１０及邻居数为３?（图６）。比较尼瓦利亚念珠菌??和布....

图７．?ａ，?Ｂｒｕｋｅｒ?ＣｌｉｎｐｒｏＴｏｏｌｓ模型中尼瓦利亚念珠菌（红色圆圈）和布加拉念珠菌（绿色圆圈）??的菌株分布图

Ｂｒｕｋｅｒ?ＣｌｉｎｐｒｏＴｏｏｌｓ模型遗传算法（ＧＡ）生成最大分辨能力的五个峰。ＧＡ设定：??模型的最大峰值数，５；最大代数，１０及邻居数为３?（图６）。比较尼瓦利亚念珠菌??和布加拉念珠菌的平均谱图（图６）和菌株分布图（图７ａ），结果表明根据其肽质??量指纹能够明显区分两种....

本文编号：3964760