东北红豆杉的谱系地理结构研究
发布时间：2020-12-27 09:54
近年东北红豆杉（Taxus cuspidata Sieb.et Zucc）遭受到了严重的人为破坏,自然种群数量锐减。了解东北红豆杉自然种群的遗传多样性和遗传结构对于评价和保护东北红豆杉的自然种群资源具有重要的理论价值和实践意义。东北红豆杉是第三纪孑遗植物,研究其谱系地理可以为推测种群遗传多样性的形成机制和物种迁移演化历史提供依据。本研究选用三个父性遗传的叶绿体DNA片段和一个母性遗传线粒体DNA片段作为遗传标记,以采集东北红豆杉中国分布范围25个居群共231个个体为研究材料,分析其居群遗传多样性和遗传结构,从而推测居群历史动态,并为该物种的保护提供理论依据。研究发现东北红豆杉居群具有较高的遗传多样性,联合叶绿体序列分析得到14个叶绿体单倍型,总的叶绿体单倍型多态性（Hd）为0.86,总的核苷酸多态性（π）为2.5 × 10-4;线粒体基因片段只检测出二种单倍型,单倍型多态性（Hd）为0.44,核苷酸多态性（i）为4.0 × 10-4。叶绿体数据分析结果显示遗传变异主要分布在居群内（98.5%）,单倍型数据分析得到的遗传分化系数GsT为0.10,与Nsr（0.09）相比没有显著差异说明东...
【文章来源】：北京林业大学北京市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：71 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－２东北红豆杉自然地理分布（摘自吴榜华，１９９５）??Ｆｉｇ．?１－２?Ｎａｔｕｒａｌ?ｇｅｏｇｒａｐｈｉｃａｌ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｚ?ｃｕｓｐｉｄａｔｅ?（Ｗｕ，?１９９５）??
?东北红豆杉的谱系地理结构研究所有提取的ＤＮＡ用超微量紫外分光光度计（ＮａｎｏＤｒｏｐ?８０００）测定ＯＤ２６０ＯＤ２８０的比值（当Ａ２６０／Ａ２８０?＝?１＿８，表示ＤＮＡ提取纯度较高，若Ａ２６０／Ａ２８０?＜?１．８表示总ＤＮＡ中有蛋白污染，而Ａ２６０／Ａ２８０?＞１．９，则样品可能有ＲＮＡ污染），再适量ｌｋｂＤＮＡ?Ｌａｄｄｅｒ?Ｍａｒｋｅｒ同时在１％琼脂糖凝胶中进行电泳跑胶，凝胶成像（ＪＹ０４Ｓ－３Ｃ）拍照，结果如下：??
ｄ??图２－３引物在东北红豆杉中的ＰＣＲ扩增结果在琼脂糖胶中的检测??ａ：?＾７７／／－；？认４引物的扩增效果；ｂ：?引物的扩增效果；??ｃ：?／＾Ｄ－＾７？ｒ引物的扩增效果；ｄ：?ｍ必／４－５引物的扩增效果??注：Ｍ代表Ｍａｒｋｅｒ?（Ｍａｒｋｅｒ?ＩＩ?），数字１－２４代表扩增产物??Ｆｉｇ．?２－３?ＰＣＲ?ｒｅｓｕｌｔｓ?ｏｆ?３?ｃｐＤＮＡ?ａｎｄ?１?ｍｔＤＮＡ?ｐｒｉｍｅｒｓ?ｕｓｅｄ?ｉｎ?ｔｈｉｓ?ｓｔｕｄｙ??ａ：?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｐｒｏｄｕｃｔ?ｏｆ?ｔｒｎＨ－ｐｓｂＡ?ｐｒｉｍｅｒ；?ｂ：?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｐｒｏｄｕｃｔ?ｏｆ?／ｒｗＬ－／＇ｐｒｉｍｅｒ；??ｃ：?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｐｒｏｄｕｃｔ?ｏｆｐｓｂＤ－ｔｒｎＴｐｒｉｍｅｒ；?ｄ：?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｐｒｏｄｕｃｔ?ｏｉｎａｄ５／Ａ－５?ｐｒｉｍｅｒ??Ｎｏｔｅ：?Ｍ：?Ｍａｒｋｅｒ?（Ｍａｒｋｅｒ?ＩＩ），?ｎｕｍｂｅｒ?１－２４：?ＰＣＲ?ｐｒｏｄｕｃｔ??２．１．２．４?ＰＣＲ产物测序??根据测序结果选择了四对多态性好且具有稳定可靠突变位点的引物，基于上ＰＣＲ反应体系和程序，进行批量扩增，本研宄从采样的２５个种群，从中选取了?２３个个体进行批量扩增，ＰＣＲ产物用０．８％琼脂糖电泳检测，然后用北京擎科新业物技术公司（ＴｓｉｎｇＫｅ，?Ｂｅｉｊｉｎｇ，?Ｃｈｉｎａ）的磁珠法进行纯化。实验流程如下：??
【参考文献】：
期刊论文
[1]东北红豆杉幼苗光合和荧光特性对不同光照条件的响应[J]. 刘彤,崔海娇,吴淑杰,祝佳媛,周志强. 北京林业大学学报. 2013(03)
[2]东北红豆杉幼苗对不同水分条件的光合和生理响应[J]. 徐博超,周志强,李威,刘彤. 北京林业大学学报. 2012(04)
[3]Phylogeography of Cyananthus delavayi(Campanulaceae) in Hengduan Mountains inferred from variation in nuclear and chloroplast DNA sequences[J]. Guo-Dong LI,Liang-Liang YUE,Hang SUN,Zi-Gang QIAN. Journal of Systematics and Evolution. 2012 (04)
[4]树龄和性别对天然东北红豆杉中紫杉醇及三尖杉宁碱质量分数的影响[J]. 刘彤,常醉,王洋,周志强. 东北林业大学学报. 2011(12)
[5]天然东北红豆杉枝中紫杉醇和三尖杉宁碱含量变化特征[J]. 常醉,周志强,夏春梅,刘彤. 北京林业大学学报. 2012(02)
[6]种内谱系地理学及在植物遗传多样性保护中的应用[J]. 徐刚标. 中南林业科技大学学报. 2011(12)
[7]东北红豆杉的繁育及养护技术研究[J]. 滕祥金,孙玉刚,曲线. 中国农学通报. 2009(12)
[8]叶籽银杏trnS-trnG序列测定与分析[J]. 董雷雷,邢世岩,李际红,王京梅. 中国农学通报. 2008(12)
[9]东北红豆杉优良无性系的筛选[J]. 张玉波,杨燕超,逄宏扬,李雪. 经济林研究. 2008(02)
[10]基于叶绿体DNA变异研究高山植物偏花报春的种内谱系地理结构(英文)[J]. 王凤英,龚洵,胡启明,郝刚. 植物分类学报. 2008(01)
本文编号：2941536
【文章来源】：北京林业大学北京市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：71 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－２东北红豆杉自然地理分布（摘自吴榜华，１９９５）??Ｆｉｇ．?１－２?Ｎａｔｕｒａｌ?ｇｅｏｇｒａｐｈｉｃａｌ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｚ?ｃｕｓｐｉｄａｔｅ?（Ｗｕ，?１９９５）??
?东北红豆杉的谱系地理结构研究所有提取的ＤＮＡ用超微量紫外分光光度计（ＮａｎｏＤｒｏｐ?８０００）测定ＯＤ２６０ＯＤ２８０的比值（当Ａ２６０／Ａ２８０?＝?１＿８，表示ＤＮＡ提取纯度较高，若Ａ２６０／Ａ２８０?＜?１．８表示总ＤＮＡ中有蛋白污染，而Ａ２６０／Ａ２８０?＞１．９，则样品可能有ＲＮＡ污染），再适量ｌｋｂＤＮＡ?Ｌａｄｄｅｒ?Ｍａｒｋｅｒ同时在１％琼脂糖凝胶中进行电泳跑胶，凝胶成像（ＪＹ０４Ｓ－３Ｃ）拍照，结果如下：??
ｄ??图２－３引物在东北红豆杉中的ＰＣＲ扩增结果在琼脂糖胶中的检测??ａ：?＾７７／／－；？认４引物的扩增效果；ｂ：?引物的扩增效果；??ｃ：?／＾Ｄ－＾７？ｒ引物的扩增效果；ｄ：?ｍ必／４－５引物的扩增效果??注：Ｍ代表Ｍａｒｋｅｒ?（Ｍａｒｋｅｒ?ＩＩ?），数字１－２４代表扩增产物??Ｆｉｇ．?２－３?ＰＣＲ?ｒｅｓｕｌｔｓ?ｏｆ?３?ｃｐＤＮＡ?ａｎｄ?１?ｍｔＤＮＡ?ｐｒｉｍｅｒｓ?ｕｓｅｄ?ｉｎ?ｔｈｉｓ?ｓｔｕｄｙ??ａ：?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｐｒｏｄｕｃｔ?ｏｆ?ｔｒｎＨ－ｐｓｂＡ?ｐｒｉｍｅｒ；?ｂ：?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｐｒｏｄｕｃｔ?ｏｆ?／ｒｗＬ－／＇ｐｒｉｍｅｒ；??ｃ：?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｐｒｏｄｕｃｔ?ｏｆｐｓｂＤ－ｔｒｎＴｐｒｉｍｅｒ；?ｄ：?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｐｒｏｄｕｃｔ?ｏｉｎａｄ５／Ａ－５?ｐｒｉｍｅｒ??Ｎｏｔｅ：?Ｍ：?Ｍａｒｋｅｒ?（Ｍａｒｋｅｒ?ＩＩ），?ｎｕｍｂｅｒ?１－２４：?ＰＣＲ?ｐｒｏｄｕｃｔ??２．１．２．４?ＰＣＲ产物测序??根据测序结果选择了四对多态性好且具有稳定可靠突变位点的引物，基于上ＰＣＲ反应体系和程序，进行批量扩增，本研宄从采样的２５个种群，从中选取了?２３个个体进行批量扩增，ＰＣＲ产物用０．８％琼脂糖电泳检测，然后用北京擎科新业物技术公司（ＴｓｉｎｇＫｅ，?Ｂｅｉｊｉｎｇ，?Ｃｈｉｎａ）的磁珠法进行纯化。实验流程如下：??
【参考文献】：
期刊论文
[1]东北红豆杉幼苗光合和荧光特性对不同光照条件的响应[J]. 刘彤,崔海娇,吴淑杰,祝佳媛,周志强. 北京林业大学学报. 2013(03)
[2]东北红豆杉幼苗对不同水分条件的光合和生理响应[J]. 徐博超,周志强,李威,刘彤. 北京林业大学学报. 2012(04)
[3]Phylogeography of Cyananthus delavayi(Campanulaceae) in Hengduan Mountains inferred from variation in nuclear and chloroplast DNA sequences[J]. Guo-Dong LI,Liang-Liang YUE,Hang SUN,Zi-Gang QIAN. Journal of Systematics and Evolution. 2012 (04)
[4]树龄和性别对天然东北红豆杉中紫杉醇及三尖杉宁碱质量分数的影响[J]. 刘彤,常醉,王洋,周志强. 东北林业大学学报. 2011(12)
[5]天然东北红豆杉枝中紫杉醇和三尖杉宁碱含量变化特征[J]. 常醉,周志强,夏春梅,刘彤. 北京林业大学学报. 2012(02)
[6]种内谱系地理学及在植物遗传多样性保护中的应用[J]. 徐刚标. 中南林业科技大学学报. 2011(12)
[7]东北红豆杉的繁育及养护技术研究[J]. 滕祥金,孙玉刚,曲线. 中国农学通报. 2009(12)
[8]叶籽银杏trnS-trnG序列测定与分析[J]. 董雷雷,邢世岩,李际红,王京梅. 中国农学通报. 2008(12)
[9]东北红豆杉优良无性系的筛选[J]. 张玉波,杨燕超,逄宏扬,李雪. 经济林研究. 2008(02)
[10]基于叶绿体DNA变异研究高山植物偏花报春的种内谱系地理结构(英文)[J]. 王凤英,龚洵,胡启明,郝刚. 植物分类学报. 2008(01)
本文编号：2941536
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