中国栎属麻栎组三个近缘物种的群体遗传学和种群动态历史研究
发布时间：2021-01-11 23:04
栎属（Quercus）是壳斗科（Fagaceae）中最大的属,该属内植物种类繁多且主要分布在北半球温和地带。栎树森林是常见的森林建群种和优势种,具有重要的经济价值和生态价值。此外,栎属物种之间的界限模糊,种间杂交或渐渗情况频繁,其演化历史与气候和环境变化密切相关。因此该属物种也被认为是研究物种适应性进化或生态物种形成的典型物种。本研究设计出596对EST-SSR引物,并对分布于中国的栎属麻栎组（Section Aegilops）三个近缘物种,即栓皮栎（Quercus variabilis）、麻栎（Quercus acutissima）以及小叶栎（Quercus chenii）的44个天然群体的759个个体（栓皮栎:19个群体336个个体,麻栎:20个群体338个个体,小叶栎:5个群体85个个体）的叶片样本进行植物基因组DNA提取。然后,从596对引物中筛选出16对扩增效果最好、多态性较高的引物,对所有基因组DNA进行扩增。最后,对所有扩增产物片段大小进行统计,并结合群体遗传学方法、ABC和SDMs对数据进行分析,探讨了三个物种的遗传结构、遗传多样性,并预测了其可能的进化历史与分布格局,...
【文章来源】：西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】：89 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
ABC分析中4个可能的历史情景Fig.1InABCanalysis,fourpossiblehistoricalscenarios.附注1：QV，栓皮栎；QA，麻栎；QC，小叶栎
第三章 麻栎组三个近缘物种的群体遗传结构与多样性比较分析第三章 麻栎组三个近缘物种的群体遗传结构与多样性比较分析3.1 中性位点、哈温平衡、无效等位基因以及连锁不平衡分析利用 LOSITAN 对 17 个位点进行中性检验（图 2），结果显示存在 4 个非中性位点（QV2、QV6、QV7 和 QV18）；其次，Bayescan2.1 分析表明（表 3），位点 QV9 和 QV1偏离中性（q<0.01）；最后结合 Arlequin3.5.2.2 软件分析（图 3），在 0.01 水平，6 个位点偏离中性即 QV2、QV6、QV9、QV16、QV17 和 QV18。综合上述三个软件的分析结果，分别有 2-6 个位点偏离中性，而位点 QV18 在三个结果中都被检测出，所以在后续分析中把该位点剔除，利用其余所有 16 个位点进行以下分析。
Table 3 The results of loci under selection in the Bayescan2.1 softwareprob log10(PO) qval alpha fstQV1 0.071214 -1.115350 0.366390 -0.030859 0.130890QV2 0.890180 0.908790 0.037741 0.727990 0.244970QV3 0.031606 -1.486300 0.515250 -0.003398 0.133610QV4 0.280660 -0.408760 0.202820 0.229610 0.169070QV6 0.964990 1.440400 0.017303 0.996490 0.298130QV7 0.952590 1.303000 0.023325 0.918660 0.281860QV8 0.090018 -1.004700 0.315260 0.053988 0.141980QV9 1.000000 1000.00 0.000000 -0.963990 0.056461QV10 0.036407 -1.422700 0.450850 -0.006623 0.133290QV11 0.048410 -1.293500 0.411410 -0.013924 0.132670QV12 0.036207 -1.425200 0.485040 0.001550 0.134240QV13 0.030006 -1.509600 0.542000 0.002041 0.134290QV14 0.965790 1.450800 0.011402 -1.003500 0.056293QV15 0.661130 0.290260 0.080759 -0.505550 0.089234QV16 0.459290 -0.070874 0.138250 0.559800 0.231820QV17 0.267450 -0.437590 0.255790 -0.289500 0.112310QV18 1.000000 1000.00 0.000000 -1.456800 0.035880
【参考文献】：
期刊论文
[1]利用EST-SSR标记构建中国老芒麦品种DNA指纹图谱及种质遗传多样性[J]. 张俊超,谢文刚,赵旭红,张宗瑜,赵永强,王彦荣. 草业科学. 2017(10)
[2]普通油茶转录组EST-SSR分子标记开发[J]. 李海波,王珊,丁红梅,陈友吾,胡传久,李楠,魏海龙. 植物生理学报. 2017(07)
[3]中国35个苦荞审定品种EST-SSR指纹图谱构建与遗传多样性分析[J]. 黎瑞源,石桃雄,陈其皎,潘凡,陈庆富. 植物科学学报. 2017(02)
[4]菠萝EST资源的SSR信息分析与开发[J]. 陈俊浩,陆洋,倪燕婕,张智俊,钟雅萍,鲍晶晶,罗淑萍. 浙江农林大学学报. 2017(02)
[5]基于EST-SSR标记的贵州野生刺梨居群遗传多样性分析[J]. 张怀山,鄢秀芹,鲁敏,王道平,安华明. 中国农业科学. 2017(06)
[6]小叶栎分布格局对末次盛冰期以来气候变化的响应[J]. 李垚,张兴旺,方炎明. 植物生态学报. 2016(11)
[7]基于EST-SSR的陕西茶树资源遗传多样性分析[J]. 陈熙,李佼,张羽,张颜青,徐凯明. 四川农业大学学报. 2016(03)
[8]文心兰EST-SSR标记的开发及其在遗传多样性分析中的应用[J]. 林榕燕,钟淮钦,黄敏玲,罗远华. 分子植物育种. 2016(11)
[9]本科遗传学教学中的遗传漂变概念探讨[J]. 王春明. 遗传. 2016(01)
[10]气候变暖对中国栓皮栎地理分布格局影响的预测[J]. 李垚,张兴旺,方炎明. 应用生态学报. 2014(12)
博士论文
[1]苏皖4种同域分布栎树的遗传变异与基因渐渗[D]. 魏高明.南京林业大学 2015
硕士论文
[1]麻栎和栓皮栎遗传多样性的AFLP分析及速生家系选择[D]. 孔倩倩.山东农业大学 2017
[2]山西省辽东栎群体遗传多样性研究[D]. 秦英英.北京林业大学 2012
[3]基于SSR标记的槲树、蒙古—辽东栎种间杂交研究[D]. 王越.山东大学 2012
[4]基于群体遗传学的黄连属DNA条形码研究[D]. 刘晓光.山东中医药大学 2012
[5]濒危植物长柄双花木的遗传多样性[D]. 李美琼.南昌大学 2011
[6]栓皮栎群体遗传结构研究[D]. 徐小林.南京林业大学 2003
本文编号：2971647
【文章来源】：西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】：89 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
ABC分析中4个可能的历史情景Fig.1InABCanalysis,fourpossiblehistoricalscenarios.附注1：QV，栓皮栎；QA，麻栎；QC，小叶栎
第三章 麻栎组三个近缘物种的群体遗传结构与多样性比较分析第三章 麻栎组三个近缘物种的群体遗传结构与多样性比较分析3.1 中性位点、哈温平衡、无效等位基因以及连锁不平衡分析利用 LOSITAN 对 17 个位点进行中性检验（图 2），结果显示存在 4 个非中性位点（QV2、QV6、QV7 和 QV18）；其次，Bayescan2.1 分析表明（表 3），位点 QV9 和 QV1偏离中性（q<0.01）；最后结合 Arlequin3.5.2.2 软件分析（图 3），在 0.01 水平，6 个位点偏离中性即 QV2、QV6、QV9、QV16、QV17 和 QV18。综合上述三个软件的分析结果，分别有 2-6 个位点偏离中性，而位点 QV18 在三个结果中都被检测出，所以在后续分析中把该位点剔除，利用其余所有 16 个位点进行以下分析。
Table 3 The results of loci under selection in the Bayescan2.1 softwareprob log10(PO) qval alpha fstQV1 0.071214 -1.115350 0.366390 -0.030859 0.130890QV2 0.890180 0.908790 0.037741 0.727990 0.244970QV3 0.031606 -1.486300 0.515250 -0.003398 0.133610QV4 0.280660 -0.408760 0.202820 0.229610 0.169070QV6 0.964990 1.440400 0.017303 0.996490 0.298130QV7 0.952590 1.303000 0.023325 0.918660 0.281860QV8 0.090018 -1.004700 0.315260 0.053988 0.141980QV9 1.000000 1000.00 0.000000 -0.963990 0.056461QV10 0.036407 -1.422700 0.450850 -0.006623 0.133290QV11 0.048410 -1.293500 0.411410 -0.013924 0.132670QV12 0.036207 -1.425200 0.485040 0.001550 0.134240QV13 0.030006 -1.509600 0.542000 0.002041 0.134290QV14 0.965790 1.450800 0.011402 -1.003500 0.056293QV15 0.661130 0.290260 0.080759 -0.505550 0.089234QV16 0.459290 -0.070874 0.138250 0.559800 0.231820QV17 0.267450 -0.437590 0.255790 -0.289500 0.112310QV18 1.000000 1000.00 0.000000 -1.456800 0.035880
【参考文献】：
期刊论文
[1]利用EST-SSR标记构建中国老芒麦品种DNA指纹图谱及种质遗传多样性[J]. 张俊超,谢文刚,赵旭红,张宗瑜,赵永强,王彦荣. 草业科学. 2017(10)
[2]普通油茶转录组EST-SSR分子标记开发[J]. 李海波,王珊,丁红梅,陈友吾,胡传久,李楠,魏海龙. 植物生理学报. 2017(07)
[3]中国35个苦荞审定品种EST-SSR指纹图谱构建与遗传多样性分析[J]. 黎瑞源,石桃雄,陈其皎,潘凡,陈庆富. 植物科学学报. 2017(02)
[4]菠萝EST资源的SSR信息分析与开发[J]. 陈俊浩,陆洋,倪燕婕,张智俊,钟雅萍,鲍晶晶,罗淑萍. 浙江农林大学学报. 2017(02)
[5]基于EST-SSR标记的贵州野生刺梨居群遗传多样性分析[J]. 张怀山,鄢秀芹,鲁敏,王道平,安华明. 中国农业科学. 2017(06)
[6]小叶栎分布格局对末次盛冰期以来气候变化的响应[J]. 李垚,张兴旺,方炎明. 植物生态学报. 2016(11)
[7]基于EST-SSR的陕西茶树资源遗传多样性分析[J]. 陈熙,李佼,张羽,张颜青,徐凯明. 四川农业大学学报. 2016(03)
[8]文心兰EST-SSR标记的开发及其在遗传多样性分析中的应用[J]. 林榕燕,钟淮钦,黄敏玲,罗远华. 分子植物育种. 2016(11)
[9]本科遗传学教学中的遗传漂变概念探讨[J]. 王春明. 遗传. 2016(01)
[10]气候变暖对中国栓皮栎地理分布格局影响的预测[J]. 李垚,张兴旺,方炎明. 应用生态学报. 2014(12)
博士论文
[1]苏皖4种同域分布栎树的遗传变异与基因渐渗[D]. 魏高明.南京林业大学 2015
硕士论文
[1]麻栎和栓皮栎遗传多样性的AFLP分析及速生家系选择[D]. 孔倩倩.山东农业大学 2017
[2]山西省辽东栎群体遗传多样性研究[D]. 秦英英.北京林业大学 2012
[3]基于SSR标记的槲树、蒙古—辽东栎种间杂交研究[D]. 王越.山东大学 2012
[4]基于群体遗传学的黄连属DNA条形码研究[D]. 刘晓光.山东中医药大学 2012
[5]濒危植物长柄双花木的遗传多样性[D]. 李美琼.南昌大学 2011
[6]栓皮栎群体遗传结构研究[D]. 徐小林.南京林业大学 2003
本文编号：2971647
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