北美红杉和巨杉的叶绿体基因组及裸子植物系统发育研究

发布时间：2024-03-25 03:25

　　叶绿体是植物光合作用的重要场所,叶绿体全基因组是绿色植物独立遗传的一种基因组类型。由于核基因信息的复杂性以及线粒体基因在植物中较慢的进化速率,碱基置换率适中的叶绿体基因组越来越多地被用于构建系统发育关系。随着高通量测序技术的发展,多种植物的叶绿体全基因组序列被获得,基于叶绿体完整基因组的系统发育基因组学研究得到较快发展。裸子植物作为被子植物的姊妹群,在植物的进化中具有重要作用。但在裸子植物的系统发育关系构建中还存在一些争议,主要有买麻藤目、银杏属、以及红杉类(北美红杉、巨杉和水杉)的系统发育位置。本研究运用高通量测序技术首先获取了北美红杉(Sequoia sempervirens)和巨杉(Sequoiadendron giganteum)两个物种的完整叶绿体基因组序列,并与已获得的近缘种水杉(Metasequoia glyptostroboides)的叶绿体基因组序列进行比较;进而通过提取NCBI数据库中67个物种(2种蕨类植物作为外类群,4个被子植物和61个裸子植物)的叶绿体完整基因组序列构建系统发育关系。主要研究结果如下:1)北美红杉和巨杉的叶绿体基因组长度分别为135,651 b...

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【部分图文】：

图３－１北美红杉物理图谱??Ｆｉｇ．?３－１?Ｇｅｎｅ??

?华东师范大学２０１７届硕士学位论文???为反式剪接基因（ｔｒａｎｓ－ｓｐｌｉｃｅｄ?ｇｅｎｅ）??

图３－２巨杉物理图谱??Ｆｉｇ．?３－２?Ｇｅｎｅ?ｍａｐ?ｏｆ?ｔｈｅ?Ｓ．?

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?６０－６５??Ｓｉｚｅ?ｏｆ?ｒｅｐｅａｔｓ?（ｂｐ）??图３－３北美红杉和巨杉Ｍｉｎｉｓａｔｅｌｌｉｔｅ的频率分布??Ｆｉｇ．?３－３?Ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ?ｏｆ?Ｍｉｎｉｓａｔｅｌｌｉｔｅ?ｂｙ?ｌｅｎｇｔｈ?ｉｎ?ｔｈｅ?ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ?ｇｅｎｏｍｅｓ?Ｓ．?ｓｅｍ....

本文编号：3938463