高脲酶活性褐土的宏基因组测序与微生物来源脲酶基因的筛选

发布时间：2024-06-29 20:00

　　为明确褐土中产脲酶微生物的来源,采集河南省郑州、洛阳、许昌、平顶山和安阳5个产区的土样并检测其脲酶活性,将脲酶活性最高的土样进行富集培养,提取土壤DNA构建宏基因组文库,采用宏基因组测序技术对褐土中的产脲酶微生物进行分析。结果表明:褐土脲酶活性在8.34～67.18μg·d-1·g-1之间。各取样点脲酶活性最高值分别为46.98、67.18、57.68、45.97和64.15μg·d-1·g-1。利用宏基因组测序数据进行序列组装,筛选到406个脲酶结构蛋白和437个脲酶辅助蛋白;物种注释表明,褐土中产脲酶微生物以细菌为主,以及少部分真菌和古细菌。产脲酶细菌与链霉菌属(Streptomyces)、节杆菌属(Arthrobacter)和不动杆菌属(Acinetobacter)等亲缘关系最近,与产脲酶真菌亲缘关系较近的有足马杜拉分枝菌(Madurella mycetomatis)、蓝莓枝枯病菌(Neofusicoccum parvum)和嗜热毛壳菌(Chaetomium thermophilum)等;产脲酶古细菌与亚硝化球菌属(Nitrososphaera)和氨氧化古菌属(Nitrosopu...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 土壤样品的采集
    1.2 土壤脲酶活性的测定
    1.3 产脲酶菌的富集培养
    1.4 宏基因组测序
    1.5 基因预测与生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 褐土脲酶酶活性的检测
    2.2 褐土中产脲酶微生物的富集培养与宏基因组测序
    2.3 基因预测与脲酶蛋白筛选
    2.4 脲酶和脲酶辅助蛋白的来源
    2.5 富集培养后褐土中产脲酶微生物的丰度
3 讨论
4 结论



本文编号：3997870