陆海渐渗系纤维长度QTL（qFL-12-2）精细定位与候选基因鉴定

发布时间：2024-03-12 00:26

　　棉花是重要的经济作物,棉纤维是最大的天然纤维来源,重要的纺织工业原料。现代纺织工业的迅猛发展,对纤维品质的要求越来越高,使棉花育种的重点由单纯提高产量向产量与品质同步提高发展。棉纤维长度是衡量纤维品质的重要指标,提高棉纤维长度已成为棉花育种的重要目标。在综合评价课题组前期构建的以海1为供体亲本,中棉所45为轮回亲本构建的332个陆海渐渗系群体基础上,选取纤维品质性状突出、产量性状与轮回亲本接近的渐渗系MBI7747与中棉所45进一步构建F2群体,然后随机分别挑选一定数量的单株种植于两个环境。以覆盖棉花全基因组的2292个SSR标记在亲本间进行多态性筛查,然后以其中的多态性标记对F2群体进行遗传检测;结合表型检测结果,利用Icimapping软件挖掘MBI7747中的与纤维主要产量和品质性状相关的QTL位点,在三个环境中共挖掘到与纤维产量与品质相关QTL共23个:1、与纤维产量相关的QTL有5个,包括衣分相关的4个,贡献率为6.95-28.86%;铃重有关的1个,贡献率为14.65%。2、与纤维品质相关的QTL共18个,包括纤维长度相关的6个,贡献率为2.05%-20.99%;纤维整齐度...

【文章页数】：123 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图２－１棉花染色体片段代换系的培育方案??Ｆｉｇ．２．１?Ｔｈｅ?ｃｕｌｔｉｖａｔｉｎｇ?ｐｒｏｇｒａｍ?ｏｆ?ｔｈｅ?ＣＳＳＬｓ??２．１．４基因组ＤＮＡ提取??

实验的亲本材料为优质渐渗系ＭＢＩ７７４７和中棉所４５?（表２－１）。ＭＢＩ７７４７??是以陆地棉中棉所４５为受体和海岛棉海１为供体构建的由３３２个染色体片??段渐渗系组成的群体（ＢＣ４Ｆ３：５）中选取的一个纤维品质优异渐渗系（图２．１）。??中棉所４５抗虫性强，产量高，纤维品质性....

图４－１生物信息分析流程图??Ｆｉｇ?４－１?Ｔｈｅ?ｆｌｏｗ?ｃｈａｒｔ?ｏｆ?ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ?ａｎａｌｙｓｉｓ??４．１．４．２差异表达基因分析??［１８４］

４．１．４生物信息学分析??研宄用的实验材料主要为陆地棉及陆地棉背景下的海陆渐渗系材料，故本研??宄后续分析以陆地棉基因组为参考基因组［１５７］。整个分析思路及流程见图４－１。??４．１．４．１数据过滤与处理??利用Ｈｉｓｅｑ２０００?ｖ４测序平台完成样品的转录组测序，测序模式为....

图4，3不同祥本间主成分分析

Ｆｉｇ?４－３?Ｔｈｅ?ｐｒｉｎｃｉｐａｌ?ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ａｍｏｎｇ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ?ｓａｍｐｌｅｓ??结果显示，在取样的的６个时间点（７ＤＰＡ、１０ＤＰＡ、１５ＤＰＡ、２０ＤＰＡ、２５ＤＰＡ），??２优质渐渗系ＭＢＩ７７４７与ＭＢＩ７５６１更多的聚合....

图4-5纤维伸长期4个阶段差异基因交集

ＸＬＯＣ＿０２５３４８与ＸＬＯＣ＿０２６９４４，全为?ＬｎｃＲＮＡ，这?２?个?ＬｎｃＲＮ还需要进一步的研宄。另外，还可以看出，在纤维伸长期的各阶特有的差异基因的数量明显高于与其它阶段共有的差异基因，这纤维伸长的调控是个动态变化的过程。??１ＱＤＰＡ?１５ＤＰＡ??＾＾＂＂＂＂＾....

本文编号：3926254