玉米C型细胞质雄性不育花粉败育相关microRNA鉴定分析

发布时间：2024-03-24 01:22

　　细胞质雄性不育(cytoplasmic male sterility,CMS)在多种植物中发现并广泛应用于植物杂交种子生产。miRNA作为植物体内一类重要的调控因子,几乎参与植物生长发育的各个组织、各个时期,研究表明一些miRNA在植物花粉中大量存在,预示着这些miRNA可能与植物花发育相关,也很可能参与调控植物育性。但有关育性相关miRNA报道多数存在于模式植物如拟南芥、水稻等,而对玉米育性相关尤其玉米C型胞质雄性不育相关miRNA的分析研究报道甚少。本研究通过Hi-Seq高通量测序技术对玉米细胞质雄性不育系C48-2及其保持系N48-2花粉母细胞时期及单核期花药中显著差异表达的miRNA并作初步功能分析,以期寻找与育性相关miRNA。同时对挖掘到的可能与育性相关的miRNA作进一步靶基因预测分析,初步探讨本实验预测到的miRNA可能参与的生物学过程。现将本实验的主要研究结果归纳如下:1.对两个材料两个时期构建的sRNAs文库进行Hi-Seq高通量测序分析共获得321个已知miRNA,属29个miRNA家族;并通过进一步分析,获得724个新的miRNA。2.生物信息学分析发现保持系N...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２－２不同组织中ｍｉＲＭＡ与其靶基因的调控关系（ＪｉｎＤＦｅｔａｌ．，２０１３）??Ｆｉｇ２－２?Ｔｈｅ?ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ?ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｍｉＲＮＡｓ?ａｎｄ?ｔｈｅｉｒ?ｔａｒｇｅｔｓ?（Ｊｉｎ?ＤＦ?ｅｔ?ａｌ．，２０１３）??调控植物环境适应性自发现ｍｉＲ３９８靶基因１９７］与耐逆性有关，大量证据证实植??物ｍｉＲＮＡ参与响应生物胁迫或非生物胁迫过程［９６］

图２－２不同组织中ｍｉＲＭＡ与其靶基因的调控关系（ＪｉｎＤＦｅｔａｌ．，２０１３）??２?Ｔｈｅ?ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ?ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｍｉＲＮＡｓ?ａｎｄ?ｔｈｅｉｒ?ｔａｒｇｅｔｓ?（Ｊｉｎ?ＤＦ?ｅｔ?ａｌ．，２物环境适应性自发现ｍｉＲ３９８靶基因....

图４－１小ＲＮＡ建库流程??Ｆｉｇ４－１?Ｓｍａｌｌ?ＲＮＡ?ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ｌｉｂｒａｒｙ?ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎ??

保持系Ｎ４８－２花粉母细胞时期记为ＮＭ，单核期记为ＮＵ。提取样品总ＲＮＡ，使用??ＰＡＧＥ胶分离不同片段大小的ＲＮＡ。切取１８－３０ｎｔ之间的条带，回收ＳｍａｌｌＲＮＡ。??构建４个小ＲＮＡ文库，建库流程如图（图４－１）??１９??

图５－１?ｓＲＮＡｓ长度分布图??Ｆｉｇ５－１?Ｔｈｅ?ｌｅｎｇｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｓＲＮＡｓ??

对于１８－３０ｎｔ的ｓＲＮＡｓ长度分布（图５－１）进行分析发现大多ｓＲＮＡ长度分布在??２１－２４ｎｔ之间，与前人的研究类似，其中２４ｎｔ占大多数，依次是２２ｎｔ，２１ｎｔ和２３ｎｔ。??Ｌｅｎｇｔｈ?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ??７０％?－ｉ???＾?６０％?■－＝???｜５０％....

图５－２?ｍｉＲＮＡ首位碱基偏好性分布??Ｆｉｇ５－２?Ｔｈｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｆｉｒｓｔ?ｂａｓｅ?ｂｉａｓ?ｏｆ?ｍｉＲＮＡ??３３??

对于１８－３０ｎｔ的ｓＲＮＡｓ长度分布（图５－１）进行分析发现大多ｓＲＮＡ长度分布在??２１－２４ｎｔ之间，与前人的研究类似，其中２４ｎｔ占大多数，依次是２２ｎｔ，２１ｎｔ和２３ｎｔ。??Ｌｅｎｇｔｈ?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ??７０％?－ｉ???＾?６０％?■－＝???｜５０％....

本文编号：3936756