患肠炎病海马的肠道细菌结构特征分析

发布时间：2024-06-12 00:08

　　肠炎病是海马人工养殖过程中常见病害,主要是细菌感染而引起的,其传染性强、危害性高。因此,解析患肠炎病海马肠道中的细菌菌群组成对于海马肠炎病的诊断以及防治有着重要意义。采集健康和患肠炎病的膨腹海马肠道组织,采用细菌16Sr DNA片段高通量测序和生物信息学分析手段,探究患肠炎病海马的肠道细菌结构特征。结果表明,健康和肠炎病海马之间的肠道菌群多样性和结构均存在显著差异。从属水平上来看,患病海马的肠道优势菌种为弧菌属Vibrio、漫游球菌属Vagococcus、分枝杆菌属Mycobacterium,健康海马的肠道优势菌种为玫瑰菌属Roseibium、拟杆菌目-未分类Bacteroidales_unclassified、弧菌属Vibrio、嗜冷菌属Psychrobacter,健康海马和患病海马中的共有属包括弧菌属Vibrio、别弧菌属Aliivibrio、拟杆菌目-未分类Bacteroidetes_unclassified、发光杆菌属Photobacterium。与健康海马肠道菌群相比,患病海马肠道中的弧菌属Vibrio、别弧属菌属Aliivibrio的...

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【部分图文】：

图5健康与患病海马肠道的差异细菌菌群

为了进一步解析健康与患病海马在属水平上的细菌群落组成的差异性，将两组样本利用STAMP进行显著性差异分析。由图5可以看出，健康海马与患病海马存在明显差异，在患病海马中，弧菌属Vibrio、漫游球菌属Vagococcus、分枝杆菌属Mycobacterium、黄杆菌属Tenacib....

图1肠道DNAPCR扩增结果

对于健康与患病海马肠道提取总细菌DNA后，使用细菌特异性引物进行了PCR扩增，结果如图1所示。从图1可见，6个样品的PCR产物条带大小正确，并且总量符合测序建库要求。进一步使用illuminaHiseq进行上机测序，6个样品得到的数据统计如表1所示。对6个样品的测序数据经过OT....

图3基于属水平的健康与患病海马肠道菌群相对丰度

其次，在细菌分类的属水平上，共鉴定出19个主要属。其中患病海马的肠道优势菌种为弧菌属Vibrio、漫游球菌属Vagococcus、分枝杆菌属Mycobacterium、β变形菌纲-未分类Betaproteobacteria＿unclassified、黄杆菌属Tenacibacul....

图4主成分分析不同样品群落结构

为了解析健康与患病海马肠道的细菌群落组成的差异性，将所有的6个样品根据OTU的类型进行了主成分分析，结果如图4所示。从图4可以看出，所有的6个样品可以明显分成2群，一群为健康海马肠道样品，另一群为患病海马肠道样品，表明2群样品之间有明显的差异性。其中健康海马肠道样品聚类较为集中，....

本文编号：3992920