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安康市花魔芋matK基因的克隆及分析

发布时间:2024-03-05 02:20
  以安康市花魔芋(Amorphophallus konjac)为材料提取基因组,对matK基因序列进行扩增,扩增产物经凝胶电泳分析后送生物技术公司测序,并对测序结果进行分析。结果表明,安康市花魔芋matK基因全长1 551 bp,预测编码516个氨基酸;系统进化树结果显示,花魔芋与Amorphophallus maxwellii、田阳魔芋(Amorphophallus corrugatus)和西盟魔芋(Amorphophallus krausei)的亲缘关系最近。

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【部分图文】:

图1花魔芋matK基因扩增产物凝胶检测结果

图1花魔芋matK基因扩增产物凝胶检测结果

对PCR扩增产物进行凝胶分析显示,扩增片段长度约1800bp(图1),与预期相符。对测序结果分析得知该基因全长1551bp,预测编码516个氨基酸(图2)。将该核苷酸序列在NCBI进行Blastn,发现该序列与花魔芋matK基因序列(AF387398.1)有2个碱基的差异....


图2花魔芋matK基因及编码氨基酸序列

图2花魔芋matK基因及编码氨基酸序列

以桑树(Morusalba)为外类群,用Neighbor-joining法构建魔芋属matK基因的系统进化树。结果(图3)显示,安康市花魔芋与Amorphophallusmaxwellii、田阳魔芋(Amorphophalluscorrugatus)和西盟魔芋(Amorph....


图3魔芋属matK序列的系统进化树

图3魔芋属matK序列的系统进化树

图2花魔芋matK基因及编码氨基酸序列3讨论



本文编号:3919521

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