SSR分子标记在梨属植物遗传多样性和群体结构研究中的应用

发布时间：2024-07-05 17:34

　　梨是世界上最重要的温带果树之一,其种质资源丰富,分布范围较广。但是由于种间的杂交亲和性造成了梨品种资源间复杂的遗传组成关系,难以通过有限的表观性状对资源进行合理评价和利用,因此本研究利用覆盖梨全基因组的核心SSR标记对不同栽培种的梨属植物以及砂梨种质资源进行了遗传多样性和群体结构分析,研究结果对梨品种资源的保存和利用具有重要的指导意义。1.研究基于134对核心SSR标记对分属于5个系统的385份梨资源进行遗传多样性分析,结果表明梨属植物具有较高的多样性。聚类分析把所有品种分成3大类,其中西洋梨与东方梨的遗传距离较远;在东方梨中,秋子梨的遗传距离较白梨和砂梨的遗传距离远。群体结构分析了K值为2-8时的群体结构组成,结果表明新疆梨是东西方梨的杂交后代,白梨和砂梨拥有共同的野生梨祖先;群体结构成分的不同也揭示了南北方梨由于环境和地理的不同造成的差异;在分类上有争议的品种’苹果梨’和’朝鲜洋梨,分别被归类到白梨和西洋梨中;核心种质筛选了 88个品种,包含了所有的稀有位点和遗传位点的95.54%。2.研究利用SSR引物对470份砂梨资源进行系统评价,所有引物均表现出较高的多态性;观测杂合度、期望...

【文章页数】：108 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２－１?３８５个梨属品种的聚类关系

２．２梨品种资源的群体结构特征??利用ＭＥＧＡ４．０软件，根据引物在不同品种的扩增情况，构建了?３８５个品种的聚??类图（图２－１），所有品种可以分为两大类：东方梨和西洋梨。东方梨进而再划分为秋??子梨、白梨和砂梨。??Ｃｌｕｓｔｅｒｌ包含６９个品种，其中有６１个西洋梨、２个新疆....

图２－２?３８５个品种在Ｋ＝２－８的群体结构??Ｆｉｇ?２．?Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?３８５?ａｃｃｅｓｓｉｏｎｓ?ｗｉｔｈ?Ｋ?ｏｆ?２?ｔｏ?８．??

２．４梨品种资源的主成分分析??利用ＰＣＡ作图对梨的遗传关系和群体结构进行了分析，所有品种被分为三大类：??白梨和砂梨、秋子梨。西洋梨（图２－３）。Ｐ１?（黄色圆）主要为白梨和砂梨；Ｐ２?（红色??圆）主要为秋子梨；Ｐ３?（蓝色圆）主要为西洋梨。同时有少量的品种分布在两个类群??....

图３－１最大似然值和Ｋ值的折线图??Ｆｉｇ?３－１?Ｔｈｅ?ｖａｌｕｅｓ?ｏｆ?Ｋ?ａｎｄ?ｔｈｅ?ｍａｘｉｍｕｍ?ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ?ａｎｄ?ｔｈｅ?Ｋ??

最大似然值的平均值确定Ｋ。利用ＳＴＲＵＣＴＵＲＥ?２．０软件（Ｐｒｉｔｃｈａｒｄ等，２０００）构建??砂梨的群体结构并对其结果进行分析。根据最大似然值的平均值确定Ｋ值，本研究中，??Ｋ＝４时存在明显的拐点（图３－１），因此确定Ｋ＝４。根据Ｋ值，把所有品种分成４大??类（图３－２）....

图３－２?４７０个砂梨的群体结构??

２．３砂梨的群体遗传分化关系??根据群体结构和ＰＣＡ的分类结果，我们比较ｊ＇?４个群体中叫两之叫Ｆｓｔ的仉，从??而来分析不同群体的分化程度。比较结果如图３－４，每个比较结果由－种颜色表示，??有图可知，不同颜色的峰值横坐标基本处在Ｎ—点，表明砂梨不Ｍ辟体的分化柷度Ｍ??本一致。....

本文编号：4001288