胡麻木酚素含量的全基因组关联分析

发布时间：2021-11-19 02:18

　　为了挖掘胡麻木酚素含量相关基因,本研究用269份胡麻种质的基因型数据和木酚素含量数据进行全基因组关联分析研究。呼和浩特、集宁、锡盟和新疆等4个环境下木酚素含量的统计分析表明:新疆伊犁地区种的269份胡麻种质平均木酚素含量为最大,变异系数依次排序为锡盟<呼和浩特<集宁<新疆,广义遗传力为60.67%。4个环境下胡麻种质木酚素含量均呈现正太分布的趋势。全基因组关联分析获得了13个显著SNP位点和21个候选基因,为胡麻分子标记辅助育种以及高木酚素含量新品种选育提供科学依据。 

【文章来源】：分子植物育种. 2020,18(03)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

269份胡麻品质(系)的木酚素含量的频率直方图

本研究用269份胡麻种质的基因型数据和木酚素含量数据进行全基因组关联分析获得了13个显著SNP位点和21个候选基因。其中，呼和浩特地区关联得到的Lus10030068和锡盟地区关联得到的Lus10020189基因功能相同，即苏氨酸蛋白激酶。说明该酶功能受多基因控制，而两个环境下均检测到了该酶基因，预测以上两个基因通过苏氨酸蛋白激酶功能来调控胡麻木酚素含量。4个环境下均检测到了酶相关基因，其中呼和浩特地区检测到了3种酶，集宁地区检测到了2种酶，锡盟地区检测到了2种酶，新疆地区检测到了1种酶。除了呼市地区以外其他3个地区均检测到了蛋白结合相关基因。木酚素含量关联的21个候选基因中集宁地区的Lus10040474、Lus1-0024628和新疆地区Lus10007629基因起始位点与相应的显著SNP位点重叠。因此，后期利用多种组学进一步研究以上三个基因调控网络(王晓丹等,218)。3 材料与方法


本文编号：3504086